Protein–RNA interactions for Protein: P59281

Arhgap39, Rho GTPase-activating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap39P59281 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Arhgap39P59281 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arhgap39P59281 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arhgap39P59281 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgap39P59281 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgap39P59281 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgap39P59281 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgap39P59281 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arhgap39P59281 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arhgap39P59281 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arhgap39P59281 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arhgap39P59281 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arhgap39P59281 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arhgap39P59281 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arhgap39P59281 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arhgap39P59281 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arhgap39P59281 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arhgap39P59281 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Arhgap39P59281 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Arhgap39P59281 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arhgap39P59281 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arhgap39P59281 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arhgap39P59281 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arhgap39P59281 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arhgap39P59281 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arhgap39P59281 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arhgap39P59281 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arhgap39P59281 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Arhgap39P59281 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Arhgap39P59281 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arhgap39P59281 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arhgap39P59281 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arhgap39P59281 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arhgap39P59281 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arhgap39P59281 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arhgap39P59281 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arhgap39P59281 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Arhgap39P59281 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arhgap39P59281 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arhgap39P59281 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arhgap39P59281 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arhgap39P59281 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Arhgap39P59281 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arhgap39P59281 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arhgap39P59281 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arhgap39P59281 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Arhgap39P59281 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Arhgap39P59281 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Arhgap39P59281 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Arhgap39P59281 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arhgap39P59281 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arhgap39P59281 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arhgap39P59281 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arhgap39P59281 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Arhgap39P59281 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arhgap39P59281 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arhgap39P59281 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arhgap39P59281 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arhgap39P59281 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arhgap39P59281 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arhgap39P59281 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arhgap39P59281 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arhgap39P59281 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arhgap39P59281 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arhgap39P59281 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arhgap39P59281 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Arhgap39P59281 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arhgap39P59281 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arhgap39P59281 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arhgap39P59281 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgap39P59281 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgap39P59281 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgap39P59281 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arhgap39P59281 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Arhgap39P59281 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Arhgap39P59281 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Arhgap39P59281 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arhgap39P59281 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arhgap39P59281 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arhgap39P59281 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arhgap39P59281 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arhgap39P59281 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arhgap39P59281 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arhgap39P59281 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arhgap39P59281 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Arhgap39P59281 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arhgap39P59281 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arhgap39P59281 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap39P59281 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap39P59281 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap39P59281 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgap39P59281 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgap39P59281 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgap39P59281 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgap39P59281 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgap39P59281 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arhgap39P59281 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap39P59281 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap39P59281 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arhgap39P59281 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms