Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tpm2P58774 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tpm2P58774 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tpm2P58774 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tpm2P58774 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tpm2P58774 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tpm2P58774 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tpm2P58774 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tpm2P58774 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tpm2P58774 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tpm2P58774 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tpm2P58774 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tpm2P58774 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tpm2P58774 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Tpm2P58774 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tpm2P58774 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tpm2P58774 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tpm2P58774 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tpm2P58774 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tpm2P58774 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tpm2P58774 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tpm2P58774 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Tpm2P58774 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tpm2P58774 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tpm2P58774 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tpm2P58774 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tpm2P58774 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tpm2P58774 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tpm2P58774 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tpm2P58774 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tpm2P58774 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tpm2P58774 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tpm2P58774 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tpm2P58774 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tpm2P58774 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tpm2P58774 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tpm2P58774 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tpm2P58774 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tpm2P58774 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tpm2P58774 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tpm2P58774 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tpm2P58774 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tpm2P58774 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tpm2P58774 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tpm2P58774 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tpm2P58774 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tpm2P58774 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tpm2P58774 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tpm2P58774 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tpm2P58774 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tpm2P58774 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tpm2P58774 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tpm2P58774 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tpm2P58774 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tpm2P58774 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tpm2P58774 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tpm2P58774 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tpm2P58774 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tpm2P58774 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tpm2P58774 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tpm2P58774 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tpm2P58774 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tpm2P58774 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Tpm2P58774 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tpm2P58774 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tpm2P58774 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tpm2P58774 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tpm2P58774 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Tpm2P58774 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tpm2P58774 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tpm2P58774 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tpm2P58774 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tpm2P58774 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Tpm2P58774 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tpm2P58774 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tpm2P58774 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tpm2P58774 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tpm2P58774 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Tpm2P58774 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tpm2P58774 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tpm2P58774 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tpm2P58774 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tpm2P58774 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tpm2P58774 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tpm2P58774 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tpm2P58774 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tpm2P58774 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tpm2P58774 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tpm2P58774 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tpm2P58774 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tpm2P58774 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tpm2P58774 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tpm2P58774 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tpm2P58774 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tpm2P58774 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tpm2P58774 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tpm2P58774 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tpm2P58774 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tpm2P58774 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tpm2P58774 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms