Protein–RNA interactions for Protein: P58196

Plscr4, Phospholipid scramblase 4, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plscr4P58196 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plscr4P58196 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plscr4P58196 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plscr4P58196 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plscr4P58196 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plscr4P58196 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plscr4P58196 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plscr4P58196 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plscr4P58196 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plscr4P58196 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plscr4P58196 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plscr4P58196 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plscr4P58196 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plscr4P58196 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Plscr4P58196 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plscr4P58196 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Plscr4P58196 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plscr4P58196 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plscr4P58196 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plscr4P58196 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plscr4P58196 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plscr4P58196 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plscr4P58196 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plscr4P58196 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plscr4P58196 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plscr4P58196 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plscr4P58196 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plscr4P58196 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plscr4P58196 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plscr4P58196 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plscr4P58196 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plscr4P58196 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plscr4P58196 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plscr4P58196 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plscr4P58196 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plscr4P58196 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plscr4P58196 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plscr4P58196 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plscr4P58196 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plscr4P58196 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plscr4P58196 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plscr4P58196 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plscr4P58196 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plscr4P58196 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plscr4P58196 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plscr4P58196 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plscr4P58196 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plscr4P58196 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plscr4P58196 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plscr4P58196 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Plscr4P58196 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plscr4P58196 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plscr4P58196 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Plscr4P58196 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plscr4P58196 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plscr4P58196 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plscr4P58196 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plscr4P58196 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plscr4P58196 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plscr4P58196 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plscr4P58196 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plscr4P58196 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Plscr4P58196 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plscr4P58196 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plscr4P58196 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Plscr4P58196 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plscr4P58196 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Plscr4P58196 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plscr4P58196 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plscr4P58196 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plscr4P58196 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plscr4P58196 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Plscr4P58196 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plscr4P58196 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plscr4P58196 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plscr4P58196 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plscr4P58196 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Plscr4P58196 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Plscr4P58196 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Plscr4P58196 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Plscr4P58196 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plscr4P58196 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plscr4P58196 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plscr4P58196 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plscr4P58196 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Plscr4P58196 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plscr4P58196 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plscr4P58196 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plscr4P58196 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plscr4P58196 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Plscr4P58196 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plscr4P58196 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plscr4P58196 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plscr4P58196 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plscr4P58196 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Plscr4P58196 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plscr4P58196 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plscr4P58196 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plscr4P58196 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plscr4P58196 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms