Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tm9sf2P58021 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tm9sf2P58021 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tm9sf2P58021 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tm9sf2P58021 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tm9sf2P58021 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tm9sf2P58021 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tm9sf2P58021 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tm9sf2P58021 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tm9sf2P58021 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tm9sf2P58021 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tm9sf2P58021 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tm9sf2P58021 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tm9sf2P58021 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tm9sf2P58021 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tm9sf2P58021 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tm9sf2P58021 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tm9sf2P58021 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tm9sf2P58021 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tm9sf2P58021 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tm9sf2P58021 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tm9sf2P58021 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tm9sf2P58021 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tm9sf2P58021 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tm9sf2P58021 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tm9sf2P58021 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tm9sf2P58021 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tm9sf2P58021 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tm9sf2P58021 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tm9sf2P58021 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tm9sf2P58021 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tm9sf2P58021 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tm9sf2P58021 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tm9sf2P58021 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tm9sf2P58021 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tm9sf2P58021 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tm9sf2P58021 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tm9sf2P58021 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tm9sf2P58021 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tm9sf2P58021 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tm9sf2P58021 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tm9sf2P58021 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tm9sf2P58021 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tm9sf2P58021 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tm9sf2P58021 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tm9sf2P58021 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tm9sf2P58021 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tm9sf2P58021 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tm9sf2P58021 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tm9sf2P58021 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tm9sf2P58021 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tm9sf2P58021 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms