Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

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Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Defb1P56386 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Defb1P56386 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Defb1P56386 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Defb1P56386 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defb1P56386 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Defb1P56386 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Defb1P56386 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Defb1P56386 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Defb1P56386 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Defb1P56386 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defb1P56386 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defb1P56386 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defb1P56386 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Defb1P56386 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Defb1P56386 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Defb1P56386 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defb1P56386 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defb1P56386 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Defb1P56386 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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