Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Acod1P54987 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Acod1P54987 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Acod1P54987 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Acod1P54987 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Acod1P54987 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Acod1P54987 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Acod1P54987 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Acod1P54987 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Acod1P54987 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Acod1P54987 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Acod1P54987 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Acod1P54987 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Acod1P54987 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Acod1P54987 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Acod1P54987 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Acod1P54987 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Acod1P54987 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Acod1P54987 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Acod1P54987 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Acod1P54987 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Acod1P54987 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Acod1P54987 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Acod1P54987 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Acod1P54987 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Acod1P54987 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Acod1P54987 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Acod1P54987 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Acod1P54987 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Acod1P54987 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Acod1P54987 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Acod1P54987 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Acod1P54987 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Acod1P54987 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Acod1P54987 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Acod1P54987 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Acod1P54987 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Acod1P54987 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Acod1P54987 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Acod1P54987 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Acod1P54987 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Acod1P54987 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Acod1P54987 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Acod1P54987 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Acod1P54987 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Acod1P54987 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Acod1P54987 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Acod1P54987 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acod1P54987 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acod1P54987 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Acod1P54987 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acod1P54987 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Acod1P54987 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acod1P54987 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acod1P54987 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acod1P54987 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Acod1P54987 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Acod1P54987 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acod1P54987 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acod1P54987 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acod1P54987 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Acod1P54987 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Acod1P54987 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Acod1P54987 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Acod1P54987 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Acod1P54987 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Acod1P54987 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Acod1P54987 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acod1P54987 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acod1P54987 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acod1P54987 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acod1P54987 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Acod1P54987 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Acod1P54987 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Acod1P54987 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Acod1P54987 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Acod1P54987 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acod1P54987 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acod1P54987 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Acod1P54987 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Acod1P54987 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Acod1P54987 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Acod1P54987 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Acod1P54987 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Acod1P54987 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Acod1P54987 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Acod1P54987 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Acod1P54987 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Acod1P54987 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Acod1P54987 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Acod1P54987 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Acod1P54987 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Acod1P54987 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Acod1P54987 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Acod1P54987 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Acod1P54987 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Acod1P54987 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Acod1P54987 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acod1P54987 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acod1P54987 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms