Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efnb1P52795 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efnb1P52795 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efnb1P52795 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efnb1P52795 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efnb1P52795 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efnb1P52795 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efnb1P52795 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Efnb1P52795 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Efnb1P52795 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efnb1P52795 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efnb1P52795 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efnb1P52795 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efnb1P52795 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efnb1P52795 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efnb1P52795 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efnb1P52795 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efnb1P52795 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efnb1P52795 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efnb1P52795 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efnb1P52795 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efnb1P52795 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efnb1P52795 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efnb1P52795 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efnb1P52795 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Efnb1P52795 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Efnb1P52795 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Efnb1P52795 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Efnb1P52795 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efnb1P52795 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efnb1P52795 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efnb1P52795 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efnb1P52795 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efnb1P52795 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efnb1P52795 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efnb1P52795 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efnb1P52795 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efnb1P52795 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efnb1P52795 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Efnb1P52795 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efnb1P52795 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efnb1P52795 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efnb1P52795 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efnb1P52795 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efnb1P52795 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efnb1P52795 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efnb1P52795 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efnb1P52795 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efnb1P52795 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efnb1P52795 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efnb1P52795 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efnb1P52795 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efnb1P52795 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efnb1P52795 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efnb1P52795 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efnb1P52795 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Efnb1P52795 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efnb1P52795 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efnb1P52795 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efnb1P52795 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efnb1P52795 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efnb1P52795 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efnb1P52795 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efnb1P52795 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efnb1P52795 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efnb1P52795 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efnb1P52795 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efnb1P52795 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efnb1P52795 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efnb1P52795 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efnb1P52795 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efnb1P52795 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Efnb1P52795 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efnb1P52795 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efnb1P52795 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efnb1P52795 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efnb1P52795 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efnb1P52795 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efnb1P52795 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efnb1P52795 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efnb1P52795 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efnb1P52795 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efnb1P52795 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efnb1P52795 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efnb1P52795 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efnb1P52795 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efnb1P52795 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efnb1P52795 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efnb1P52795 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efnb1P52795 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efnb1P52795 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Efnb1P52795 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Efnb1P52795 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efnb1P52795 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efnb1P52795 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efnb1P52795 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Efnb1P52795 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Efnb1P52795 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Efnb1P52795 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Efnb1P52795 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms