Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Csrp3P50462 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Csrp3P50462 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Csrp3P50462 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Csrp3P50462 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Csrp3P50462 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Csrp3P50462 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Csrp3P50462 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Csrp3P50462 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Csrp3P50462 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Csrp3P50462 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Csrp3P50462 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Csrp3P50462 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Csrp3P50462 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Csrp3P50462 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Csrp3P50462 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Csrp3P50462 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Csrp3P50462 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Csrp3P50462 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Csrp3P50462 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Csrp3P50462 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Csrp3P50462 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Csrp3P50462 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Csrp3P50462 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Csrp3P50462 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Csrp3P50462 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Csrp3P50462 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Csrp3P50462 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Csrp3P50462 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Csrp3P50462 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Csrp3P50462 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Csrp3P50462 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Csrp3P50462 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Csrp3P50462 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Csrp3P50462 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Csrp3P50462 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Csrp3P50462 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Csrp3P50462 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Csrp3P50462 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Csrp3P50462 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Csrp3P50462 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Csrp3P50462 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Csrp3P50462 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Csrp3P50462 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Csrp3P50462 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Csrp3P50462 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Csrp3P50462 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Csrp3P50462 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Csrp3P50462 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Csrp3P50462 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Csrp3P50462 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Csrp3P50462 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Csrp3P50462 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Csrp3P50462 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Csrp3P50462 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Csrp3P50462 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Csrp3P50462 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Csrp3P50462 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Csrp3P50462 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Csrp3P50462 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Csrp3P50462 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Csrp3P50462 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Csrp3P50462 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Csrp3P50462 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Csrp3P50462 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Csrp3P50462 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Csrp3P50462 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Csrp3P50462 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Csrp3P50462 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Csrp3P50462 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csrp3P50462 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Csrp3P50462 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Csrp3P50462 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Csrp3P50462 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Csrp3P50462 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Csrp3P50462 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Csrp3P50462 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Csrp3P50462 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csrp3P50462 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csrp3P50462 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Csrp3P50462 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Csrp3P50462 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Csrp3P50462 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csrp3P50462 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csrp3P50462 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csrp3P50462 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Csrp3P50462 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Csrp3P50462 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Csrp3P50462 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Csrp3P50462 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Csrp3P50462 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Csrp3P50462 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Csrp3P50462 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrp3P50462 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrp3P50462 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrp3P50462 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Csrp3P50462 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csrp3P50462 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csrp3P50462 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Csrp3P50462 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms