Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdkn1cP49919 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdkn1cP49919 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdkn1cP49919 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdkn1cP49919 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdkn1cP49919 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdkn1cP49919 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdkn1cP49919 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdkn1cP49919 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdkn1cP49919 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdkn1cP49919 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdkn1cP49919 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdkn1cP49919 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdkn1cP49919 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdkn1cP49919 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdkn1cP49919 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdkn1cP49919 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdkn1cP49919 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdkn1cP49919 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdkn1cP49919 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdkn1cP49919 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdkn1cP49919 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdkn1cP49919 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdkn1cP49919 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdkn1cP49919 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdkn1cP49919 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdkn1cP49919 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cdkn1cP49919 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdkn1cP49919 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cdkn1cP49919 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Cdkn1cP49919 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Cdkn1cP49919 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Cdkn1cP49919 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cdkn1cP49919 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cdkn1cP49919 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdkn1cP49919 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdkn1cP49919 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdkn1cP49919 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdkn1cP49919 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdkn1cP49919 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdkn1cP49919 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdkn1cP49919 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdkn1cP49919 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdkn1cP49919 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdkn1cP49919 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdkn1cP49919 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdkn1cP49919 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdkn1cP49919 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdkn1cP49919 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdkn1cP49919 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdkn1cP49919 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdkn1cP49919 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdkn1cP49919 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdkn1cP49919 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdkn1cP49919 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdkn1cP49919 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdkn1cP49919 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdkn1cP49919 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cdkn1cP49919 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdkn1cP49919 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdkn1cP49919 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdkn1cP49919 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdkn1cP49919 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdkn1cP49919 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdkn1cP49919 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdkn1cP49919 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdkn1cP49919 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdkn1cP49919 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdkn1cP49919 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdkn1cP49919 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdkn1cP49919 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdkn1cP49919 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdkn1cP49919 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdkn1cP49919 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdkn1cP49919 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdkn1cP49919 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdkn1cP49919 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdkn1cP49919 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdkn1cP49919 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdkn1cP49919 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdkn1cP49919 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdkn1cP49919 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdkn1cP49919 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdkn1cP49919 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdkn1cP49919 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdkn1cP49919 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdkn1cP49919 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdkn1cP49919 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdkn1cP49919 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdkn1cP49919 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdkn1cP49919 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdkn1cP49919 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdkn1cP49919 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdkn1cP49919 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdkn1cP49919 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdkn1cP49919 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdkn1cP49919 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdkn1cP49919 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdkn1cP49919 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdkn1cP49919 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms