Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Psen1P49769 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Psen1P49769 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Psen1P49769 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Psen1P49769 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Psen1P49769 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Psen1P49769 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Psen1P49769 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Psen1P49769 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Psen1P49769 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Psen1P49769 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Psen1P49769 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Psen1P49769 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Psen1P49769 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Psen1P49769 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Psen1P49769 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Psen1P49769 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Psen1P49769 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Psen1P49769 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Psen1P49769 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Psen1P49769 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Psen1P49769 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Psen1P49769 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Psen1P49769 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Psen1P49769 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Psen1P49769 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Psen1P49769 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psen1P49769 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psen1P49769 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psen1P49769 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psen1P49769 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Psen1P49769 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psen1P49769 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psen1P49769 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psen1P49769 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psen1P49769 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Psen1P49769 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psen1P49769 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psen1P49769 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psen1P49769 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Psen1P49769 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Psen1P49769 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Psen1P49769 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Psen1P49769 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Psen1P49769 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Psen1P49769 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Psen1P49769 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Psen1P49769 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Psen1P49769 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Psen1P49769 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Psen1P49769 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Psen1P49769 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Psen1P49769 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Psen1P49769 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Psen1P49769 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Psen1P49769 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Psen1P49769 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Psen1P49769 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Psen1P49769 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Psen1P49769 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Psen1P49769 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Psen1P49769 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Psen1P49769 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psen1P49769 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Psen1P49769 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psen1P49769 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psen1P49769 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psen1P49769 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psen1P49769 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psen1P49769 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psen1P49769 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psen1P49769 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psen1P49769 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psen1P49769 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Psen1P49769 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Psen1P49769 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Psen1P49769 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Psen1P49769 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Psen1P49769 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Psen1P49769 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Psen1P49769 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Psen1P49769 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Psen1P49769 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Psen1P49769 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Psen1P49769 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Psen1P49769 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Psen1P49769 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Psen1P49769 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Psen1P49769 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psen1P49769 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psen1P49769 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psen1P49769 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psen1P49769 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Psen1P49769 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Psen1P49769 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psen1P49769 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psen1P49769 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psen1P49769 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psen1P49769 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psen1P49769 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms