Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtpreP49446 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PtpreP49446 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PtpreP49446 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PtpreP49446 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtpreP49446 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PtpreP49446 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PtpreP49446 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PtpreP49446 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtpreP49446 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtpreP49446 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PtpreP49446 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtpreP49446 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PtpreP49446 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PtpreP49446 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtpreP49446 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PtpreP49446 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtpreP49446 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtpreP49446 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PtpreP49446 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtpreP49446 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PtpreP49446 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PtpreP49446 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PtpreP49446 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtpreP49446 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtpreP49446 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtpreP49446 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtpreP49446 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PtpreP49446 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PtpreP49446 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PtpreP49446 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtpreP49446 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PtpreP49446 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PtpreP49446 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtpreP49446 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtpreP49446 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtpreP49446 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PtpreP49446 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PtpreP49446 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PtpreP49446 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PtpreP49446 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PtpreP49446 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PtpreP49446 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PtpreP49446 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtpreP49446 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PtpreP49446 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PtpreP49446 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PtpreP49446 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PtpreP49446 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PtpreP49446 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PtpreP49446 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PtpreP49446 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtpreP49446 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtpreP49446 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtpreP49446 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PtpreP49446 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtpreP49446 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PtpreP49446 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PtpreP49446 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PtpreP49446 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtpreP49446 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtpreP49446 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtpreP49446 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtpreP49446 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtpreP49446 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtpreP49446 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtpreP49446 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtpreP49446 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtpreP49446 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtpreP49446 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtpreP49446 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PtpreP49446 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtpreP49446 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtpreP49446 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtpreP49446 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtpreP49446 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtpreP49446 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtpreP49446 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtpreP49446 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtpreP49446 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PtpreP49446 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtpreP49446 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtpreP49446 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtpreP49446 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtpreP49446 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtpreP49446 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtpreP49446 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtpreP49446 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtpreP49446 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtpreP49446 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtpreP49446 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtpreP49446 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtpreP49446 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtpreP49446 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtpreP49446 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtpreP49446 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PtpreP49446 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PtpreP49446 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PtpreP49446 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PtpreP49446 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms