Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HpdP49429 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HpdP49429 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HpdP49429 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HpdP49429 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HpdP49429 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HpdP49429 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HpdP49429 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HpdP49429 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HpdP49429 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HpdP49429 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HpdP49429 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HpdP49429 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HpdP49429 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HpdP49429 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HpdP49429 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HpdP49429 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HpdP49429 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HpdP49429 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HpdP49429 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HpdP49429 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HpdP49429 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HpdP49429 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HpdP49429 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HpdP49429 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HpdP49429 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HpdP49429 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HpdP49429 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HpdP49429 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HpdP49429 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HpdP49429 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HpdP49429 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HpdP49429 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HpdP49429 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HpdP49429 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HpdP49429 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HpdP49429 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HpdP49429 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HpdP49429 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HpdP49429 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HpdP49429 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HpdP49429 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HpdP49429 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HpdP49429 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HpdP49429 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HpdP49429 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HpdP49429 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HpdP49429 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HpdP49429 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HpdP49429 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HpdP49429 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HpdP49429 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HpdP49429 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HpdP49429 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HpdP49429 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HpdP49429 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HpdP49429 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HpdP49429 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HpdP49429 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HpdP49429 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HpdP49429 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HpdP49429 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HpdP49429 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HpdP49429 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HpdP49429 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HpdP49429 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HpdP49429 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HpdP49429 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HpdP49429 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HpdP49429 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HpdP49429 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HpdP49429 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HpdP49429 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HpdP49429 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HpdP49429 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HpdP49429 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HpdP49429 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HpdP49429 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HpdP49429 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HpdP49429 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HpdP49429 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HpdP49429 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HpdP49429 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HpdP49429 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HpdP49429 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HpdP49429 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HpdP49429 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HpdP49429 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HpdP49429 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HpdP49429 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HpdP49429 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HpdP49429 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HpdP49429 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HpdP49429 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HpdP49429 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HpdP49429 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HpdP49429 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HpdP49429 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HpdP49429 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HpdP49429 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.9 ms