Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccl11P48298 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccl11P48298 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccl11P48298 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccl11P48298 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccl11P48298 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccl11P48298 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccl11P48298 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccl11P48298 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccl11P48298 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccl11P48298 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccl11P48298 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccl11P48298 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccl11P48298 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccl11P48298 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccl11P48298 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccl11P48298 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccl11P48298 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccl11P48298 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccl11P48298 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccl11P48298 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccl11P48298 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccl11P48298 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccl11P48298 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccl11P48298 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccl11P48298 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccl11P48298 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccl11P48298 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccl11P48298 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccl11P48298 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccl11P48298 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccl11P48298 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccl11P48298 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccl11P48298 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccl11P48298 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccl11P48298 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccl11P48298 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccl11P48298 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccl11P48298 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccl11P48298 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccl11P48298 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccl11P48298 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccl11P48298 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccl11P48298 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccl11P48298 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccl11P48298 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccl11P48298 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccl11P48298 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccl11P48298 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccl11P48298 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccl11P48298 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccl11P48298 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccl11P48298 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccl11P48298 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccl11P48298 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccl11P48298 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccl11P48298 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccl11P48298 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccl11P48298 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccl11P48298 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccl11P48298 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccl11P48298 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccl11P48298 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccl11P48298 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccl11P48298 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccl11P48298 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccl11P48298 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccl11P48298 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccl11P48298 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccl11P48298 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccl11P48298 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccl11P48298 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccl11P48298 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccl11P48298 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccl11P48298 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccl11P48298 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccl11P48298 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccl11P48298 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccl11P48298 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccl11P48298 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccl11P48298 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccl11P48298 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccl11P48298 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccl11P48298 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccl11P48298 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccl11P48298 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccl11P48298 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccl11P48298 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccl11P48298 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccl11P48298 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccl11P48298 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccl11P48298 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccl11P48298 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccl11P48298 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccl11P48298 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccl11P48298 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccl11P48298 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccl11P48298 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccl11P48298 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccl11P48298 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms