Protein–RNA interactions for Protein: P43688

Nkx2-6, Homeobox protein Nkx-2.6, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-6P43688 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx2-6P43688 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nkx2-6P43688 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nkx2-6P43688 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nkx2-6P43688 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx2-6P43688 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx2-6P43688 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx2-6P43688 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx2-6P43688 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx2-6P43688 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx2-6P43688 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx2-6P43688 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx2-6P43688 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkx2-6P43688 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkx2-6P43688 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkx2-6P43688 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx2-6P43688 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx2-6P43688 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx2-6P43688 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkx2-6P43688 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nkx2-6P43688 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nkx2-6P43688 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nkx2-6P43688 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx2-6P43688 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx2-6P43688 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx2-6P43688 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nkx2-6P43688 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nkx2-6P43688 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nkx2-6P43688 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nkx2-6P43688 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nkx2-6P43688 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nkx2-6P43688 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nkx2-6P43688 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkx2-6P43688 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkx2-6P43688 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkx2-6P43688 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx2-6P43688 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx2-6P43688 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx2-6P43688 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx2-6P43688 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx2-6P43688 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx2-6P43688 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx2-6P43688 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx2-6P43688 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx2-6P43688 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx2-6P43688 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nkx2-6P43688 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx2-6P43688 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx2-6P43688 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx2-6P43688 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx2-6P43688 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nkx2-6P43688 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nkx2-6P43688 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nkx2-6P43688 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx2-6P43688 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx2-6P43688 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx2-6P43688 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nkx2-6P43688 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nkx2-6P43688 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nkx2-6P43688 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nkx2-6P43688 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nkx2-6P43688 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nkx2-6P43688 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nkx2-6P43688 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nkx2-6P43688 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nkx2-6P43688 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nkx2-6P43688 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nkx2-6P43688 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nkx2-6P43688 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nkx2-6P43688 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nkx2-6P43688 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nkx2-6P43688 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nkx2-6P43688 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nkx2-6P43688 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nkx2-6P43688 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkx2-6P43688 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nkx2-6P43688 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nkx2-6P43688 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nkx2-6P43688 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nkx2-6P43688 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkx2-6P43688 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkx2-6P43688 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nkx2-6P43688 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx2-6P43688 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nkx2-6P43688 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nkx2-6P43688 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nkx2-6P43688 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nkx2-6P43688 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nkx2-6P43688 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nkx2-6P43688 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx2-6P43688 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx2-6P43688 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx2-6P43688 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nkx2-6P43688 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nkx2-6P43688 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nkx2-6P43688 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkx2-6P43688 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkx2-6P43688 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx2-6P43688 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx2-6P43688 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms