Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ItgavP43406 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ItgavP43406 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ItgavP43406 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ItgavP43406 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ItgavP43406 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ItgavP43406 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ItgavP43406 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ItgavP43406 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ItgavP43406 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ItgavP43406 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ItgavP43406 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ItgavP43406 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ItgavP43406 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ItgavP43406 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ItgavP43406 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ItgavP43406 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ItgavP43406 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ItgavP43406 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ItgavP43406 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ItgavP43406 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ItgavP43406 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ItgavP43406 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ItgavP43406 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ItgavP43406 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ItgavP43406 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ItgavP43406 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ItgavP43406 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ItgavP43406 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ItgavP43406 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ItgavP43406 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ItgavP43406 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ItgavP43406 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ItgavP43406 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ItgavP43406 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ItgavP43406 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ItgavP43406 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ItgavP43406 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ItgavP43406 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ItgavP43406 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ItgavP43406 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ItgavP43406 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ItgavP43406 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ItgavP43406 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ItgavP43406 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ItgavP43406 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ItgavP43406 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ItgavP43406 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ItgavP43406 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ItgavP43406 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ItgavP43406 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ItgavP43406 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ItgavP43406 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ItgavP43406 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ItgavP43406 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ItgavP43406 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ItgavP43406 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ItgavP43406 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ItgavP43406 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ItgavP43406 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ItgavP43406 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ItgavP43406 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ItgavP43406 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ItgavP43406 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ItgavP43406 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ItgavP43406 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ItgavP43406 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ItgavP43406 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ItgavP43406 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ItgavP43406 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ItgavP43406 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ItgavP43406 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ItgavP43406 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ItgavP43406 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ItgavP43406 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ItgavP43406 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ItgavP43406 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ItgavP43406 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ItgavP43406 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ItgavP43406 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ItgavP43406 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ItgavP43406 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ItgavP43406 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ItgavP43406 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ItgavP43406 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ItgavP43406 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ItgavP43406 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ItgavP43406 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ItgavP43406 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ItgavP43406 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ItgavP43406 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ItgavP43406 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ItgavP43406 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ItgavP43406 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ItgavP43406 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ItgavP43406 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ItgavP43406 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ItgavP43406 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ItgavP43406 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ItgavP43406 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms