Protein–RNA interactions for Protein: P43352

Rad52, DNA repair protein RAD52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad52P43352 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rad52P43352 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rad52P43352 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rad52P43352 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rad52P43352 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rad52P43352 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rad52P43352 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rad52P43352 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rad52P43352 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rad52P43352 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rad52P43352 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad52P43352 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad52P43352 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rad52P43352 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rad52P43352 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rad52P43352 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rad52P43352 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad52P43352 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad52P43352 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rad52P43352 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rad52P43352 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rad52P43352 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rad52P43352 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rad52P43352 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad52P43352 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad52P43352 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad52P43352 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad52P43352 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad52P43352 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad52P43352 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad52P43352 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad52P43352 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad52P43352 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad52P43352 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad52P43352 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad52P43352 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad52P43352 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad52P43352 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad52P43352 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad52P43352 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad52P43352 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad52P43352 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad52P43352 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad52P43352 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rad52P43352 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rad52P43352 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rad52P43352 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad52P43352 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad52P43352 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad52P43352 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad52P43352 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad52P43352 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad52P43352 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad52P43352 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad52P43352 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad52P43352 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rad52P43352 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rad52P43352 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad52P43352 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rad52P43352 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rad52P43352 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rad52P43352 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rad52P43352 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad52P43352 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rad52P43352 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rad52P43352 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad52P43352 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad52P43352 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad52P43352 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad52P43352 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad52P43352 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad52P43352 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rad52P43352 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad52P43352 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad52P43352 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad52P43352 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad52P43352 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad52P43352 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad52P43352 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad52P43352 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad52P43352 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad52P43352 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad52P43352 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad52P43352 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad52P43352 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad52P43352 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad52P43352 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad52P43352 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad52P43352 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad52P43352 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad52P43352 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rad52P43352 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rad52P43352 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rad52P43352 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rad52P43352 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rad52P43352 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rad52P43352 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rad52P43352 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rad52P43352 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rad52P43352 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms