Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl28P41105 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl28P41105 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl28P41105 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl28P41105 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl28P41105 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl28P41105 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl28P41105 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl28P41105 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl28P41105 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl28P41105 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl28P41105 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl28P41105 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl28P41105 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl28P41105 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl28P41105 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl28P41105 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl28P41105 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rpl28P41105 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl28P41105 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl28P41105 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl28P41105 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl28P41105 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl28P41105 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl28P41105 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl28P41105 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl28P41105 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl28P41105 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl28P41105 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl28P41105 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl28P41105 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl28P41105 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl28P41105 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl28P41105 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl28P41105 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl28P41105 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl28P41105 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl28P41105 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl28P41105 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl28P41105 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl28P41105 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl28P41105 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl28P41105 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl28P41105 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl28P41105 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl28P41105 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl28P41105 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl28P41105 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl28P41105 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl28P41105 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl28P41105 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl28P41105 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl28P41105 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl28P41105 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl28P41105 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl28P41105 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl28P41105 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl28P41105 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl28P41105 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl28P41105 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl28P41105 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl28P41105 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl28P41105 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl28P41105 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl28P41105 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl28P41105 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl28P41105 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl28P41105 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl28P41105 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl28P41105 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl28P41105 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl28P41105 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl28P41105 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl28P41105 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl28P41105 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl28P41105 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl28P41105 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl28P41105 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl28P41105 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl28P41105 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl28P41105 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl28P41105 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl28P41105 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl28P41105 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl28P41105 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl28P41105 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl28P41105 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl28P41105 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl28P41105 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl28P41105 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl28P41105 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl28P41105 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl28P41105 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl28P41105 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl28P41105 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl28P41105 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl28P41105 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rpl28P41105 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl28P41105 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl28P41105 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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