Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
PtprkP35822 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
PtprkP35822 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
PtprkP35822 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC42.36■■■■■ 4.37
PtprkP35822 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
PtprkP35822 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC42.34■■■■■ 4.37
PtprkP35822 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
PtprkP35822 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
PtprkP35822 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
PtprkP35822 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
PtprkP35822 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
PtprkP35822 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
PtprkP35822 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
PtprkP35822 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
PtprkP35822 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
PtprkP35822 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
PtprkP35822 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
PtprkP35822 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
PtprkP35822 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
PtprkP35822 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC42.19■■■■■ 4.34
PtprkP35822 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
PtprkP35822 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
PtprkP35822 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
PtprkP35822 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
PtprkP35822 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
PtprkP35822 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
PtprkP35822 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.34
PtprkP35822 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
PtprkP35822 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
PtprkP35822 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
PtprkP35822 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
PtprkP35822 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
PtprkP35822 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
PtprkP35822 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
PtprkP35822 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
PtprkP35822 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
PtprkP35822 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
PtprkP35822 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
PtprkP35822 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
PtprkP35822 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
PtprkP35822 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
PtprkP35822 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
PtprkP35822 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
PtprkP35822 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
PtprkP35822 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.88■■■■■ 4.29
PtprkP35822 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
PtprkP35822 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
PtprkP35822 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
PtprkP35822 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
PtprkP35822 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
PtprkP35822 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
PtprkP35822 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
PtprkP35822 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
PtprkP35822 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
PtprkP35822 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
PtprkP35822 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
PtprkP35822 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
PtprkP35822 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
PtprkP35822 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC41.7■■■■■ 4.27
PtprkP35822 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
PtprkP35822 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
PtprkP35822 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
PtprkP35822 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
PtprkP35822 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
PtprkP35822 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
PtprkP35822 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
PtprkP35822 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
PtprkP35822 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
PtprkP35822 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
PtprkP35822 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
PtprkP35822 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
PtprkP35822 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
PtprkP35822 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC41.53■■■■■ 4.24
PtprkP35822 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
PtprkP35822 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC41.51■■■■■ 4.24
PtprkP35822 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
PtprkP35822 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
PtprkP35822 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
PtprkP35822 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
PtprkP35822 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
PtprkP35822 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC41.45■■■■■ 4.23
PtprkP35822 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.23
PtprkP35822 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.23
PtprkP35822 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
PtprkP35822 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
PtprkP35822 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
PtprkP35822 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
PtprkP35822 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
PtprkP35822 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
PtprkP35822 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
PtprkP35822 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
PtprkP35822 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
PtprkP35822 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
PtprkP35822 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.32■■■■■ 4.2
PtprkP35822 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
PtprkP35822 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
PtprkP35822 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
PtprkP35822 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
PtprkP35822 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
PtprkP35822 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms