Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Ddit3P35639 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ddit3P35639 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ddit3P35639 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ddit3P35639 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ddit3P35639 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ddit3P35639 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Ddit3P35639 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ddit3P35639 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ddit3P35639 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ddit3P35639 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ddit3P35639 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ddit3P35639 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ddit3P35639 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
Ddit3P35639 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ddit3P35639 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ddit3P35639 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ddit3P35639 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ddit3P35639 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ddit3P35639 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ddit3P35639 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ddit3P35639 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ddit3P35639 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ddit3P35639 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Ddit3P35639 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ddit3P35639 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ddit3P35639 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ddit3P35639 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ddit3P35639 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ddit3P35639 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ddit3P35639 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ddit3P35639 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ddit3P35639 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ddit3P35639 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ddit3P35639 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ddit3P35639 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Ddit3P35639 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ddit3P35639 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ddit3P35639 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ddit3P35639 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ddit3P35639 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ddit3P35639 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ddit3P35639 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ddit3P35639 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ddit3P35639 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ddit3P35639 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ddit3P35639 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ddit3P35639 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ddit3P35639 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ddit3P35639 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ddit3P35639 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ddit3P35639 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ddit3P35639 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ddit3P35639 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ddit3P35639 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ddit3P35639 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ddit3P35639 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ddit3P35639 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ddit3P35639 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ddit3P35639 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ddit3P35639 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ddit3P35639 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ddit3P35639 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ddit3P35639 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ddit3P35639 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ddit3P35639 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ddit3P35639 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ddit3P35639 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ddit3P35639 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Ddit3P35639 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Ddit3P35639 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ddit3P35639 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ddit3P35639 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ddit3P35639 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ddit3P35639 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ddit3P35639 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ddit3P35639 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ddit3P35639 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Ddit3P35639 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ddit3P35639 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ddit3P35639 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ddit3P35639 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ddit3P35639 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ddit3P35639 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ddit3P35639 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ddit3P35639 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ddit3P35639 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ddit3P35639 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ddit3P35639 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ddit3P35639 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ddit3P35639 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ddit3P35639 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ddit3P35639 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ddit3P35639 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ddit3P35639 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Ddit3P35639 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ddit3P35639 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ddit3P35639 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ddit3P35639 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ddit3P35639 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms