Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ptpn11P35235 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ptpn11P35235 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ptpn11P35235 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ptpn11P35235 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ptpn11P35235 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ptpn11P35235 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ptpn11P35235 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ptpn11P35235 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ptpn11P35235 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ptpn11P35235 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ptpn11P35235 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ptpn11P35235 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ptpn11P35235 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ptpn11P35235 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ptpn11P35235 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ptpn11P35235 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ptpn11P35235 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ptpn11P35235 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ptpn11P35235 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ptpn11P35235 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ptpn11P35235 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ptpn11P35235 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ptpn11P35235 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ptpn11P35235 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ptpn11P35235 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ptpn11P35235 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ptpn11P35235 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ptpn11P35235 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ptpn11P35235 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ptpn11P35235 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ptpn11P35235 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ptpn11P35235 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ptpn11P35235 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ptpn11P35235 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ptpn11P35235 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ptpn11P35235 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ptpn11P35235 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ptpn11P35235 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ptpn11P35235 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ptpn11P35235 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ptpn11P35235 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ptpn11P35235 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ptpn11P35235 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ptpn11P35235 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ptpn11P35235 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ptpn11P35235 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ptpn11P35235 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ptpn11P35235 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ptpn11P35235 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ptpn11P35235 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ptpn11P35235 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ptpn11P35235 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ptpn11P35235 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ptpn11P35235 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ptpn11P35235 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ptpn11P35235 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ptpn11P35235 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ptpn11P35235 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ptpn11P35235 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ptpn11P35235 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ptpn11P35235 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ptpn11P35235 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ptpn11P35235 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ptpn11P35235 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ptpn11P35235 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ptpn11P35235 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ptpn11P35235 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ptpn11P35235 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ptpn11P35235 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ptpn11P35235 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ptpn11P35235 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ptpn11P35235 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ptpn11P35235 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ptpn11P35235 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ptpn11P35235 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ptpn11P35235 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ptpn11P35235 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ptpn11P35235 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ptpn11P35235 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ptpn11P35235 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ptpn11P35235 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ptpn11P35235 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ptpn11P35235 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ptpn11P35235 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ptpn11P35235 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ptpn11P35235 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ptpn11P35235 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ptpn11P35235 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ptpn11P35235 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ptpn11P35235 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ptpn11P35235 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ptpn11P35235 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ptpn11P35235 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ptpn11P35235 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ptpn11P35235 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ptpn11P35235 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ptpn11P35235 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ptpn11P35235 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ptpn11P35235 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms