Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mmp13P33435 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mmp13P33435 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mmp13P33435 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mmp13P33435 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mmp13P33435 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mmp13P33435 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mmp13P33435 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mmp13P33435 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mmp13P33435 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mmp13P33435 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mmp13P33435 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mmp13P33435 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mmp13P33435 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mmp13P33435 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mmp13P33435 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mmp13P33435 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mmp13P33435 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mmp13P33435 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mmp13P33435 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mmp13P33435 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mmp13P33435 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mmp13P33435 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mmp13P33435 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mmp13P33435 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mmp13P33435 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mmp13P33435 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Mmp13P33435 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mmp13P33435 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mmp13P33435 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mmp13P33435 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mmp13P33435 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mmp13P33435 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mmp13P33435 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mmp13P33435 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Mmp13P33435 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mmp13P33435 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mmp13P33435 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mmp13P33435 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mmp13P33435 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mmp13P33435 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Mmp13P33435 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mmp13P33435 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mmp13P33435 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mmp13P33435 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mmp13P33435 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mmp13P33435 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mmp13P33435 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mmp13P33435 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mmp13P33435 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mmp13P33435 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mmp13P33435 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Mmp13P33435 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mmp13P33435 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mmp13P33435 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mmp13P33435 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mmp13P33435 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mmp13P33435 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mmp13P33435 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mmp13P33435 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mmp13P33435 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mmp13P33435 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mmp13P33435 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mmp13P33435 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mmp13P33435 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mmp13P33435 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mmp13P33435 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mmp13P33435 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mmp13P33435 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mmp13P33435 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mmp13P33435 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mmp13P33435 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mmp13P33435 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mmp13P33435 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mmp13P33435 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mmp13P33435 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mmp13P33435 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mmp13P33435 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mmp13P33435 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mmp13P33435 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mmp13P33435 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mmp13P33435 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Mmp13P33435 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mmp13P33435 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mmp13P33435 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mmp13P33435 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Mmp13P33435 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mmp13P33435 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mmp13P33435 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mmp13P33435 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mmp13P33435 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mmp13P33435 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mmp13P33435 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mmp13P33435 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mmp13P33435 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Mmp13P33435 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mmp13P33435 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mmp13P33435 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mmp13P33435 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mmp13P33435 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms