Protein–RNA interactions for Protein: P32114

Pax2, Paired box protein Pax-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax2P32114 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pax2P32114 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pax2P32114 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pax2P32114 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pax2P32114 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pax2P32114 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pax2P32114 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pax2P32114 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pax2P32114 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pax2P32114 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pax2P32114 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pax2P32114 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pax2P32114 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pax2P32114 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pax2P32114 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pax2P32114 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pax2P32114 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Pax2P32114 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pax2P32114 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pax2P32114 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pax2P32114 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pax2P32114 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pax2P32114 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pax2P32114 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pax2P32114 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pax2P32114 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pax2P32114 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pax2P32114 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pax2P32114 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pax2P32114 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pax2P32114 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pax2P32114 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pax2P32114 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pax2P32114 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pax2P32114 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pax2P32114 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pax2P32114 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pax2P32114 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Pax2P32114 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pax2P32114 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pax2P32114 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pax2P32114 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pax2P32114 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pax2P32114 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pax2P32114 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pax2P32114 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pax2P32114 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pax2P32114 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pax2P32114 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pax2P32114 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pax2P32114 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pax2P32114 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pax2P32114 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pax2P32114 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pax2P32114 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pax2P32114 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pax2P32114 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pax2P32114 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pax2P32114 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pax2P32114 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pax2P32114 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pax2P32114 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pax2P32114 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pax2P32114 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pax2P32114 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pax2P32114 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pax2P32114 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pax2P32114 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pax2P32114 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pax2P32114 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pax2P32114 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pax2P32114 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pax2P32114 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pax2P32114 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pax2P32114 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pax2P32114 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pax2P32114 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pax2P32114 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pax2P32114 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pax2P32114 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pax2P32114 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pax2P32114 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pax2P32114 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pax2P32114 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pax2P32114 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pax2P32114 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pax2P32114 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pax2P32114 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pax2P32114 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pax2P32114 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pax2P32114 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pax2P32114 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pax2P32114 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pax2P32114 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pax2P32114 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pax2P32114 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pax2P32114 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pax2P32114 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pax2P32114 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pax2P32114 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms