Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mmp3P28862 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mmp3P28862 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mmp3P28862 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mmp3P28862 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mmp3P28862 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mmp3P28862 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mmp3P28862 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mmp3P28862 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Mmp3P28862 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mmp3P28862 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mmp3P28862 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mmp3P28862 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mmp3P28862 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mmp3P28862 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Mmp3P28862 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mmp3P28862 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mmp3P28862 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mmp3P28862 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mmp3P28862 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mmp3P28862 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mmp3P28862 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mmp3P28862 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mmp3P28862 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mmp3P28862 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mmp3P28862 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Mmp3P28862 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Mmp3P28862 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mmp3P28862 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mmp3P28862 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mmp3P28862 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mmp3P28862 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mmp3P28862 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Mmp3P28862 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mmp3P28862 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mmp3P28862 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mmp3P28862 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mmp3P28862 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mmp3P28862 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mmp3P28862 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mmp3P28862 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mmp3P28862 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mmp3P28862 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mmp3P28862 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mmp3P28862 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mmp3P28862 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mmp3P28862 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mmp3P28862 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mmp3P28862 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mmp3P28862 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Mmp3P28862 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mmp3P28862 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Mmp3P28862 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mmp3P28862 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mmp3P28862 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Mmp3P28862 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mmp3P28862 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mmp3P28862 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mmp3P28862 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Mmp3P28862 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mmp3P28862 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mmp3P28862 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mmp3P28862 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Mmp3P28862 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Mmp3P28862 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mmp3P28862 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Mmp3P28862 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mmp3P28862 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mmp3P28862 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mmp3P28862 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mmp3P28862 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Mmp3P28862 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Mmp3P28862 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mmp3P28862 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mmp3P28862 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mmp3P28862 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mmp3P28862 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mmp3P28862 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mmp3P28862 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mmp3P28862 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Mmp3P28862 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mmp3P28862 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Mmp3P28862 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mmp3P28862 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mmp3P28862 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mmp3P28862 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mmp3P28862 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mmp3P28862 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mmp3P28862 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mmp3P28862 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mmp3P28862 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mmp3P28862 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mmp3P28862 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mmp3P28862 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mmp3P28862 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mmp3P28862 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mmp3P28862 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mmp3P28862 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mmp3P28862 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mmp3P28862 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms