Protein–RNA interactions for Protein: P28660

Nckap1, Nck-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1P28660 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nckap1P28660 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nckap1P28660 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nckap1P28660 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nckap1P28660 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nckap1P28660 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nckap1P28660 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nckap1P28660 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nckap1P28660 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nckap1P28660 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nckap1P28660 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nckap1P28660 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nckap1P28660 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nckap1P28660 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nckap1P28660 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Nckap1P28660 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nckap1P28660 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nckap1P28660 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nckap1P28660 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nckap1P28660 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nckap1P28660 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nckap1P28660 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nckap1P28660 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nckap1P28660 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nckap1P28660 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nckap1P28660 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nckap1P28660 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nckap1P28660 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nckap1P28660 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nckap1P28660 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nckap1P28660 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nckap1P28660 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nckap1P28660 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nckap1P28660 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nckap1P28660 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nckap1P28660 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nckap1P28660 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nckap1P28660 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nckap1P28660 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nckap1P28660 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nckap1P28660 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nckap1P28660 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nckap1P28660 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nckap1P28660 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nckap1P28660 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nckap1P28660 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nckap1P28660 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nckap1P28660 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nckap1P28660 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nckap1P28660 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nckap1P28660 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nckap1P28660 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nckap1P28660 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nckap1P28660 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Nckap1P28660 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Nckap1P28660 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nckap1P28660 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nckap1P28660 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nckap1P28660 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nckap1P28660 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nckap1P28660 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nckap1P28660 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nckap1P28660 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nckap1P28660 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nckap1P28660 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nckap1P28660 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nckap1P28660 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nckap1P28660 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nckap1P28660 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nckap1P28660 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nckap1P28660 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nckap1P28660 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nckap1P28660 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nckap1P28660 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nckap1P28660 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nckap1P28660 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nckap1P28660 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nckap1P28660 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nckap1P28660 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Nckap1P28660 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nckap1P28660 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nckap1P28660 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nckap1P28660 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nckap1P28660 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nckap1P28660 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nckap1P28660 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nckap1P28660 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nckap1P28660 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nckap1P28660 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nckap1P28660 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nckap1P28660 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nckap1P28660 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nckap1P28660 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nckap1P28660 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nckap1P28660 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nckap1P28660 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nckap1P28660 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nckap1P28660 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nckap1P28660 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nckap1P28660 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms