Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Defa3P28310 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa3P28310 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa3P28310 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa3P28310 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa3P28310 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa3P28310 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa3P28310 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa3P28310 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa3P28310 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa3P28310 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa3P28310 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa3P28310 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa3P28310 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa3P28310 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa3P28310 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa3P28310 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa3P28310 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa3P28310 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa3P28310 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa3P28310 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa3P28310 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa3P28310 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa3P28310 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa3P28310 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa3P28310 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa3P28310 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa3P28310 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa3P28310 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa3P28310 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa3P28310 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Defa3P28310 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa3P28310 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa3P28310 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa3P28310 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa3P28310 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa3P28310 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa3P28310 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa3P28310 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa3P28310 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa3P28310 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa3P28310 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa3P28310 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa3P28310 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa3P28310 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa3P28310 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa3P28310 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa3P28310 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa3P28310 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa3P28310 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa3P28310 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa3P28310 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa3P28310 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa3P28310 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa3P28310 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa3P28310 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa3P28310 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa3P28310 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa3P28310 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa3P28310 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa3P28310 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa3P28310 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa3P28310 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa3P28310 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa3P28310 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa3P28310 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa3P28310 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa3P28310 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa3P28310 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa3P28310 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa3P28310 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa3P28310 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa3P28310 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa3P28310 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa3P28310 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa3P28310 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa3P28310 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa3P28310 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa3P28310 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa3P28310 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Defa3P28310 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Defa3P28310 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa3P28310 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa3P28310 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa3P28310 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa3P28310 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa3P28310 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa3P28310 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa3P28310 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa3P28310 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa3P28310 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa3P28310 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa3P28310 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa3P28310 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa3P28310 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa3P28310 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa3P28310 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Defa3P28310 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa3P28310 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa3P28310 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms