Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Aco1P28271 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Aco1P28271 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Aco1P28271 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Aco1P28271 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Aco1P28271 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Aco1P28271 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Aco1P28271 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Aco1P28271 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Aco1P28271 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Aco1P28271 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Aco1P28271 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Aco1P28271 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Aco1P28271 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Aco1P28271 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Aco1P28271 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Aco1P28271 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Aco1P28271 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Aco1P28271 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Aco1P28271 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Aco1P28271 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Aco1P28271 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Aco1P28271 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Aco1P28271 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Aco1P28271 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Aco1P28271 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Aco1P28271 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Aco1P28271 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Aco1P28271 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Aco1P28271 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Aco1P28271 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Aco1P28271 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Aco1P28271 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Aco1P28271 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Aco1P28271 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Aco1P28271 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Aco1P28271 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Aco1P28271 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Aco1P28271 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Aco1P28271 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Aco1P28271 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Aco1P28271 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Aco1P28271 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Aco1P28271 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Aco1P28271 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Aco1P28271 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Aco1P28271 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Aco1P28271 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Aco1P28271 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Aco1P28271 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Aco1P28271 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Aco1P28271 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Aco1P28271 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Aco1P28271 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Aco1P28271 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Aco1P28271 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Aco1P28271 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Aco1P28271 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Aco1P28271 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Aco1P28271 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Aco1P28271 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Aco1P28271 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Aco1P28271 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Aco1P28271 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Aco1P28271 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Aco1P28271 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Aco1P28271 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Aco1P28271 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Aco1P28271 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Aco1P28271 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Aco1P28271 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Aco1P28271 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Aco1P28271 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Aco1P28271 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Aco1P28271 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Aco1P28271 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Aco1P28271 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Aco1P28271 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Aco1P28271 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Aco1P28271 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Aco1P28271 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Aco1P28271 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Aco1P28271 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Aco1P28271 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Aco1P28271 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Aco1P28271 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Aco1P28271 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Aco1P28271 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Aco1P28271 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Aco1P28271 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Aco1P28271 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Aco1P28271 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Aco1P28271 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Aco1P28271 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Aco1P28271 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Aco1P28271 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Aco1P28271 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Aco1P28271 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Aco1P28271 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Aco1P28271 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms