Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BrafP28028 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BrafP28028 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BrafP28028 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BrafP28028 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BrafP28028 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BrafP28028 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BrafP28028 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BrafP28028 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BrafP28028 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BrafP28028 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BrafP28028 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BrafP28028 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BrafP28028 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BrafP28028 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BrafP28028 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BrafP28028 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BrafP28028 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BrafP28028 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BrafP28028 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BrafP28028 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BrafP28028 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BrafP28028 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BrafP28028 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BrafP28028 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BrafP28028 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BrafP28028 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BrafP28028 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BrafP28028 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BrafP28028 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BrafP28028 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BrafP28028 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BrafP28028 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BrafP28028 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BrafP28028 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BrafP28028 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BrafP28028 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BrafP28028 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BrafP28028 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BrafP28028 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BrafP28028 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BrafP28028 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BrafP28028 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BrafP28028 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BrafP28028 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BrafP28028 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BrafP28028 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BrafP28028 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BrafP28028 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BrafP28028 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BrafP28028 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BrafP28028 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BrafP28028 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BrafP28028 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BrafP28028 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BrafP28028 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BrafP28028 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BrafP28028 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BrafP28028 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BrafP28028 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BrafP28028 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BrafP28028 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BrafP28028 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BrafP28028 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BrafP28028 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BrafP28028 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BrafP28028 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BrafP28028 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BrafP28028 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BrafP28028 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BrafP28028 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BrafP28028 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BrafP28028 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BrafP28028 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BrafP28028 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BrafP28028 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BrafP28028 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BrafP28028 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BrafP28028 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BrafP28028 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BrafP28028 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
BrafP28028 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BrafP28028 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BrafP28028 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BrafP28028 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BrafP28028 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BrafP28028 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BrafP28028 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BrafP28028 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BrafP28028 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BrafP28028 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BrafP28028 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BrafP28028 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BrafP28028 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BrafP28028 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BrafP28028 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BrafP28028 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BrafP28028 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BrafP28028 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BrafP28028 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms