Protein–RNA interactions for Protein: P27048

Snrpb, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpbP27048 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnrpbP27048 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SnrpbP27048 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnrpbP27048 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SnrpbP27048 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrpbP27048 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnrpbP27048 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SnrpbP27048 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SnrpbP27048 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SnrpbP27048 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SnrpbP27048 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SnrpbP27048 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SnrpbP27048 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SnrpbP27048 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SnrpbP27048 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SnrpbP27048 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SnrpbP27048 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SnrpbP27048 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SnrpbP27048 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SnrpbP27048 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SnrpbP27048 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SnrpbP27048 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SnrpbP27048 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SnrpbP27048 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SnrpbP27048 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SnrpbP27048 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SnrpbP27048 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SnrpbP27048 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SnrpbP27048 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SnrpbP27048 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SnrpbP27048 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SnrpbP27048 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SnrpbP27048 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SnrpbP27048 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SnrpbP27048 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SnrpbP27048 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SnrpbP27048 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SnrpbP27048 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SnrpbP27048 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SnrpbP27048 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SnrpbP27048 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SnrpbP27048 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SnrpbP27048 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SnrpbP27048 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SnrpbP27048 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SnrpbP27048 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SnrpbP27048 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SnrpbP27048 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SnrpbP27048 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SnrpbP27048 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SnrpbP27048 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SnrpbP27048 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SnrpbP27048 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SnrpbP27048 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SnrpbP27048 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SnrpbP27048 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SnrpbP27048 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SnrpbP27048 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SnrpbP27048 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SnrpbP27048 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SnrpbP27048 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SnrpbP27048 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SnrpbP27048 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SnrpbP27048 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SnrpbP27048 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SnrpbP27048 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SnrpbP27048 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SnrpbP27048 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SnrpbP27048 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SnrpbP27048 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SnrpbP27048 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SnrpbP27048 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SnrpbP27048 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SnrpbP27048 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SnrpbP27048 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SnrpbP27048 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SnrpbP27048 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SnrpbP27048 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SnrpbP27048 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SnrpbP27048 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SnrpbP27048 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SnrpbP27048 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SnrpbP27048 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SnrpbP27048 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SnrpbP27048 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SnrpbP27048 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SnrpbP27048 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SnrpbP27048 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SnrpbP27048 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SnrpbP27048 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SnrpbP27048 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SnrpbP27048 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SnrpbP27048 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SnrpbP27048 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SnrpbP27048 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SnrpbP27048 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SnrpbP27048 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SnrpbP27048 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SnrpbP27048 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnrpbP27048 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms