Protein–RNA interactions for Protein: P26039

Tln1, Talin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tln1P26039 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tln1P26039 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tln1P26039 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tln1P26039 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tln1P26039 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tln1P26039 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tln1P26039 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tln1P26039 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tln1P26039 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tln1P26039 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tln1P26039 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tln1P26039 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tln1P26039 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tln1P26039 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tln1P26039 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tln1P26039 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tln1P26039 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tln1P26039 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tln1P26039 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tln1P26039 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tln1P26039 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tln1P26039 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tln1P26039 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tln1P26039 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tln1P26039 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tln1P26039 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tln1P26039 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tln1P26039 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tln1P26039 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tln1P26039 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tln1P26039 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tln1P26039 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tln1P26039 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tln1P26039 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tln1P26039 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tln1P26039 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tln1P26039 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tln1P26039 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tln1P26039 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tln1P26039 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tln1P26039 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tln1P26039 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tln1P26039 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tln1P26039 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tln1P26039 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tln1P26039 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tln1P26039 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tln1P26039 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tln1P26039 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tln1P26039 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tln1P26039 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tln1P26039 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tln1P26039 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tln1P26039 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tln1P26039 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tln1P26039 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tln1P26039 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tln1P26039 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tln1P26039 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tln1P26039 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tln1P26039 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tln1P26039 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tln1P26039 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tln1P26039 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tln1P26039 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tln1P26039 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tln1P26039 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tln1P26039 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tln1P26039 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tln1P26039 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tln1P26039 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tln1P26039 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tln1P26039 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tln1P26039 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tln1P26039 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tln1P26039 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tln1P26039 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tln1P26039 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tln1P26039 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tln1P26039 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tln1P26039 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tln1P26039 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tln1P26039 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tln1P26039 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tln1P26039 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tln1P26039 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tln1P26039 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tln1P26039 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tln1P26039 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tln1P26039 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tln1P26039 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tln1P26039 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tln1P26039 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tln1P26039 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tln1P26039 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tln1P26039 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tln1P26039 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tln1P26039 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tln1P26039 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tln1P26039 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms