Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Cdk11bP24788 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Cdk11bP24788 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Cdk11bP24788 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Cdk11bP24788 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Cdk11bP24788 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Cdk11bP24788 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Cdk11bP24788 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Cdk11bP24788 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Cdk11bP24788 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Cdk11bP24788 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Cdk11bP24788 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Cdk11bP24788 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Cdk11bP24788 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Cdk11bP24788 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Cdk11bP24788 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Cdk11bP24788 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Cdk11bP24788 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Cdk11bP24788 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Cdk11bP24788 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Cdk11bP24788 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Cdk11bP24788 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Cdk11bP24788 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Cdk11bP24788 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Cdk11bP24788 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Cdk11bP24788 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Cdk11bP24788 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
Cdk11bP24788 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Cdk11bP24788 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Cdk11bP24788 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Cdk11bP24788 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Cdk11bP24788 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Cdk11bP24788 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Cdk11bP24788 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Cdk11bP24788 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Cdk11bP24788 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Cdk11bP24788 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Cdk11bP24788 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
Cdk11bP24788 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Cdk11bP24788 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Cdk11bP24788 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Cdk11bP24788 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Cdk11bP24788 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Cdk11bP24788 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Cdk11bP24788 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Cdk11bP24788 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Cdk11bP24788 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Cdk11bP24788 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Cdk11bP24788 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Cdk11bP24788 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Cdk11bP24788 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Cdk11bP24788 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Cdk11bP24788 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
Cdk11bP24788 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Cdk11bP24788 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Cdk11bP24788 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
Cdk11bP24788 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Cdk11bP24788 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Cdk11bP24788 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Cdk11bP24788 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Cdk11bP24788 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Cdk11bP24788 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Cdk11bP24788 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Cdk11bP24788 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Cdk11bP24788 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Cdk11bP24788 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Cdk11bP24788 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
Cdk11bP24788 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
Cdk11bP24788 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Cdk11bP24788 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Cdk11bP24788 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Cdk11bP24788 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Cdk11bP24788 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Cdk11bP24788 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Cdk11bP24788 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
Cdk11bP24788 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
Cdk11bP24788 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Cdk11bP24788 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Cdk11bP24788 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Cdk11bP24788 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Cdk11bP24788 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Cdk11bP24788 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Cdk11bP24788 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Cdk11bP24788 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Cdk11bP24788 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Cdk11bP24788 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Cdk11bP24788 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Cdk11bP24788 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Cdk11bP24788 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Cdk11bP24788 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Cdk11bP24788 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Cdk11bP24788 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Cdk11bP24788 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Cdk11bP24788 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Cdk11bP24788 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Cdk11bP24788 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Cdk11bP24788 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Cdk11bP24788 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
Cdk11bP24788 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Cdk11bP24788 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms