Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Htr3aP23979 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Htr3aP23979 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Htr3aP23979 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Htr3aP23979 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Htr3aP23979 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Htr3aP23979 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Htr3aP23979 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Htr3aP23979 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Htr3aP23979 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Htr3aP23979 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Htr3aP23979 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Htr3aP23979 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Htr3aP23979 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Htr3aP23979 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Htr3aP23979 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Htr3aP23979 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Htr3aP23979 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Htr3aP23979 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Htr3aP23979 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Htr3aP23979 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Htr3aP23979 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Htr3aP23979 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Htr3aP23979 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Htr3aP23979 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Htr3aP23979 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Htr3aP23979 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Htr3aP23979 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Htr3aP23979 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Htr3aP23979 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Htr3aP23979 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Htr3aP23979 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Htr3aP23979 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Htr3aP23979 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Htr3aP23979 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Htr3aP23979 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Htr3aP23979 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Htr3aP23979 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Htr3aP23979 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Htr3aP23979 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Htr3aP23979 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Htr3aP23979 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Htr3aP23979 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Htr3aP23979 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Htr3aP23979 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Htr3aP23979 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Htr3aP23979 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Htr3aP23979 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Htr3aP23979 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Htr3aP23979 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Htr3aP23979 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Htr3aP23979 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Htr3aP23979 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Htr3aP23979 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Htr3aP23979 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Htr3aP23979 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Htr3aP23979 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Htr3aP23979 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Htr3aP23979 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Htr3aP23979 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Htr3aP23979 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Htr3aP23979 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Htr3aP23979 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Htr3aP23979 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Htr3aP23979 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Htr3aP23979 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Htr3aP23979 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Htr3aP23979 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Htr3aP23979 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Htr3aP23979 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Htr3aP23979 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Htr3aP23979 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Htr3aP23979 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Htr3aP23979 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Htr3aP23979 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Htr3aP23979 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Htr3aP23979 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Htr3aP23979 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Htr3aP23979 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Htr3aP23979 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Htr3aP23979 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Htr3aP23979 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Htr3aP23979 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Htr3aP23979 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Htr3aP23979 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Htr3aP23979 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Htr3aP23979 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Htr3aP23979 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Htr3aP23979 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Htr3aP23979 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Htr3aP23979 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Htr3aP23979 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Htr3aP23979 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Htr3aP23979 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Htr3aP23979 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Htr3aP23979 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Htr3aP23979 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Htr3aP23979 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Htr3aP23979 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Htr3aP23979 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms