Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gria1P23818 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gria1P23818 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gria1P23818 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gria1P23818 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gria1P23818 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gria1P23818 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gria1P23818 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gria1P23818 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gria1P23818 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gria1P23818 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gria1P23818 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gria1P23818 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gria1P23818 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gria1P23818 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gria1P23818 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gria1P23818 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gria1P23818 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gria1P23818 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gria1P23818 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gria1P23818 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gria1P23818 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gria1P23818 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gria1P23818 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gria1P23818 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gria1P23818 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gria1P23818 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gria1P23818 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gria1P23818 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gria1P23818 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gria1P23818 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gria1P23818 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gria1P23818 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gria1P23818 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gria1P23818 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gria1P23818 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gria1P23818 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gria1P23818 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gria1P23818 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gria1P23818 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gria1P23818 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gria1P23818 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gria1P23818 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gria1P23818 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gria1P23818 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gria1P23818 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gria1P23818 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gria1P23818 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gria1P23818 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gria1P23818 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gria1P23818 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gria1P23818 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gria1P23818 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gria1P23818 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gria1P23818 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gria1P23818 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gria1P23818 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gria1P23818 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gria1P23818 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gria1P23818 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gria1P23818 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gria1P23818 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gria1P23818 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gria1P23818 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gria1P23818 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gria1P23818 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gria1P23818 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gria1P23818 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gria1P23818 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gria1P23818 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gria1P23818 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gria1P23818 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gria1P23818 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gria1P23818 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gria1P23818 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gria1P23818 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gria1P23818 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gria1P23818 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gria1P23818 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gria1P23818 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gria1P23818 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gria1P23818 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gria1P23818 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gria1P23818 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gria1P23818 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gria1P23818 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gria1P23818 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gria1P23818 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gria1P23818 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gria1P23818 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gria1P23818 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gria1P23818 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gria1P23818 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gria1P23818 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gria1P23818 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gria1P23818 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gria1P23818 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gria1P23818 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gria1P23818 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gria1P23818 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms