Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ggta1P23336 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ggta1P23336 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ggta1P23336 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ggta1P23336 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ggta1P23336 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ggta1P23336 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ggta1P23336 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ggta1P23336 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ggta1P23336 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ggta1P23336 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ggta1P23336 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ggta1P23336 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ggta1P23336 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ggta1P23336 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ggta1P23336 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ggta1P23336 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ggta1P23336 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ggta1P23336 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ggta1P23336 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ggta1P23336 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ggta1P23336 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ggta1P23336 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ggta1P23336 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ggta1P23336 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ggta1P23336 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ggta1P23336 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ggta1P23336 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ggta1P23336 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ggta1P23336 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ggta1P23336 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ggta1P23336 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ggta1P23336 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ggta1P23336 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ggta1P23336 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ggta1P23336 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ggta1P23336 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ggta1P23336 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ggta1P23336 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ggta1P23336 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ggta1P23336 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ggta1P23336 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ggta1P23336 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ggta1P23336 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ggta1P23336 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ggta1P23336 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ggta1P23336 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ggta1P23336 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Ggta1P23336 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ggta1P23336 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ggta1P23336 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ggta1P23336 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ggta1P23336 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ggta1P23336 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ggta1P23336 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ggta1P23336 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ggta1P23336 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ggta1P23336 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ggta1P23336 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ggta1P23336 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ggta1P23336 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ggta1P23336 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ggta1P23336 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ggta1P23336 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ggta1P23336 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ggta1P23336 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ggta1P23336 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ggta1P23336 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ggta1P23336 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ggta1P23336 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ggta1P23336 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ggta1P23336 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ggta1P23336 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ggta1P23336 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ggta1P23336 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ggta1P23336 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ggta1P23336 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ggta1P23336 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ggta1P23336 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ggta1P23336 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ggta1P23336 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ggta1P23336 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ggta1P23336 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ggta1P23336 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ggta1P23336 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ggta1P23336 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ggta1P23336 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ggta1P23336 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ggta1P23336 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ggta1P23336 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ggta1P23336 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ggta1P23336 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ggta1P23336 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ggta1P23336 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ggta1P23336 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ggta1P23336 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ggta1P23336 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ggta1P23336 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ggta1P23336 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ggta1P23336 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms