Protein–RNA interactions for Protein: P21278

Gna11, Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gna11P21278 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gna11P21278 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gna11P21278 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gna11P21278 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gna11P21278 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gna11P21278 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gna11P21278 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gna11P21278 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gna11P21278 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gna11P21278 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gna11P21278 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gna11P21278 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gna11P21278 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gna11P21278 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gna11P21278 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gna11P21278 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gna11P21278 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gna11P21278 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gna11P21278 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gna11P21278 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gna11P21278 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gna11P21278 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gna11P21278 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gna11P21278 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gna11P21278 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gna11P21278 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Gna11P21278 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gna11P21278 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Gna11P21278 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gna11P21278 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Gna11P21278 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gna11P21278 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gna11P21278 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gna11P21278 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gna11P21278 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gna11P21278 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Gna11P21278 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gna11P21278 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gna11P21278 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gna11P21278 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gna11P21278 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gna11P21278 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gna11P21278 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gna11P21278 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Gna11P21278 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gna11P21278 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gna11P21278 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gna11P21278 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gna11P21278 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gna11P21278 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gna11P21278 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gna11P21278 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gna11P21278 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Gna11P21278 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gna11P21278 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gna11P21278 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gna11P21278 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gna11P21278 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Gna11P21278 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gna11P21278 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gna11P21278 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gna11P21278 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gna11P21278 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gna11P21278 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gna11P21278 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gna11P21278 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gna11P21278 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gna11P21278 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gna11P21278 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gna11P21278 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gna11P21278 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gna11P21278 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gna11P21278 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gna11P21278 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gna11P21278 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gna11P21278 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gna11P21278 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Gna11P21278 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gna11P21278 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gna11P21278 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gna11P21278 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gna11P21278 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gna11P21278 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gna11P21278 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gna11P21278 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gna11P21278 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Gna11P21278 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gna11P21278 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Gna11P21278 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gna11P21278 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gna11P21278 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gna11P21278 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gna11P21278 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gna11P21278 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gna11P21278 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gna11P21278 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gna11P21278 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gna11P21278 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gna11P21278 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gna11P21278 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms