Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
P20040 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P20040 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P20040 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P20040 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P20040 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P20040 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P20040 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
P20040 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
P20040 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P20040 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P20040 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P20040 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P20040 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P20040 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P20040 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P20040 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P20040 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P20040 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P20040 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P20040 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P20040 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
P20040 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P20040 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P20040 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P20040 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P20040 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P20040 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P20040 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P20040 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P20040 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P20040 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P20040 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P20040 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P20040 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P20040 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P20040 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P20040 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P20040 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P20040 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P20040 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P20040 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P20040 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P20040 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P20040 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
P20040 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P20040 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P20040 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P20040 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
P20040 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P20040 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P20040 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P20040 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
P20040 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
P20040 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P20040 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P20040 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
P20040 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P20040 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P20040 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P20040 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P20040 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P20040 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P20040 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P20040 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
P20040 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P20040 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
P20040 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P20040 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
P20040 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P20040 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P20040 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P20040 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P20040 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
P20040 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P20040 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
P20040 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P20040 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P20040 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
P20040 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P20040 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P20040 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P20040 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P20040 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P20040 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P20040 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P20040 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P20040 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P20040 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
P20040 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P20040 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
P20040 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
P20040 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P20040 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P20040 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P20040 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P20040 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P20040 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P20040 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P20040 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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