Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl13aP19253 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl13aP19253 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl13aP19253 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl13aP19253 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl13aP19253 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl13aP19253 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl13aP19253 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl13aP19253 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl13aP19253 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl13aP19253 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl13aP19253 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl13aP19253 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl13aP19253 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl13aP19253 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl13aP19253 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl13aP19253 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl13aP19253 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl13aP19253 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl13aP19253 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl13aP19253 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl13aP19253 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl13aP19253 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl13aP19253 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl13aP19253 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl13aP19253 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl13aP19253 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl13aP19253 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl13aP19253 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl13aP19253 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl13aP19253 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl13aP19253 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl13aP19253 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl13aP19253 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl13aP19253 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl13aP19253 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl13aP19253 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl13aP19253 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl13aP19253 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl13aP19253 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl13aP19253 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl13aP19253 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl13aP19253 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl13aP19253 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl13aP19253 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl13aP19253 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl13aP19253 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl13aP19253 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl13aP19253 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13aP19253 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13aP19253 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13aP19253 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13aP19253 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13aP19253 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13aP19253 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13aP19253 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl13aP19253 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl13aP19253 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl13aP19253 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13aP19253 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13aP19253 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13aP19253 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl13aP19253 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl13aP19253 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl13aP19253 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl13aP19253 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13aP19253 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13aP19253 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13aP19253 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13aP19253 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13aP19253 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl13aP19253 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl13aP19253 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl13aP19253 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl13aP19253 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl13aP19253 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl13aP19253 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl13aP19253 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl13aP19253 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl13aP19253 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl13aP19253 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl13aP19253 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl13aP19253 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl13aP19253 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl13aP19253 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13aP19253 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13aP19253 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl13aP19253 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl13aP19253 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl13aP19253 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl13aP19253 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl13aP19253 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl13aP19253 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl13aP19253 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl13aP19253 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl13aP19253 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl13aP19253 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl13aP19253 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl13aP19253 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl13aP19253 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms