Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RargP18911 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RargP18911 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RargP18911 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RargP18911 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RargP18911 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RargP18911 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RargP18911 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RargP18911 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RargP18911 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RargP18911 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RargP18911 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RargP18911 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RargP18911 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RargP18911 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RargP18911 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RargP18911 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RargP18911 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RargP18911 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RargP18911 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RargP18911 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RargP18911 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RargP18911 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RargP18911 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RargP18911 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RargP18911 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RargP18911 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RargP18911 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RargP18911 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RargP18911 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RargP18911 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RargP18911 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RargP18911 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RargP18911 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RargP18911 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RargP18911 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RargP18911 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RargP18911 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RargP18911 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RargP18911 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RargP18911 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RargP18911 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RargP18911 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RargP18911 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RargP18911 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RargP18911 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RargP18911 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RargP18911 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RargP18911 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RargP18911 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RargP18911 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RargP18911 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RargP18911 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RargP18911 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RargP18911 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RargP18911 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RargP18911 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RargP18911 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RargP18911 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RargP18911 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RargP18911 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RargP18911 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RargP18911 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RargP18911 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RargP18911 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RargP18911 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RargP18911 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RargP18911 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RargP18911 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RargP18911 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RargP18911 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RargP18911 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RargP18911 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RargP18911 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RargP18911 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RargP18911 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RargP18911 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RargP18911 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RargP18911 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RargP18911 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RargP18911 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RargP18911 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RargP18911 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RargP18911 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RargP18911 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RargP18911 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RargP18911 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RargP18911 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RargP18911 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RargP18911 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RargP18911 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RargP18911 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RargP18911 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RargP18911 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RargP18911 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RargP18911 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RargP18911 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RargP18911 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RargP18911 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RargP18911 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms