Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rps6ka3P18654 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rps6ka3P18654 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rps6ka3P18654 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rps6ka3P18654 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rps6ka3P18654 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rps6ka3P18654 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rps6ka3P18654 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps6ka3P18654 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rps6ka3P18654 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rps6ka3P18654 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rps6ka3P18654 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rps6ka3P18654 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps6ka3P18654 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps6ka3P18654 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps6ka3P18654 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rps6ka3P18654 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rps6ka3P18654 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rps6ka3P18654 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rps6ka3P18654 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6ka3P18654 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6ka3P18654 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps6ka3P18654 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rps6ka3P18654 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rps6ka3P18654 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps6ka3P18654 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rps6ka3P18654 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rps6ka3P18654 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rps6ka3P18654 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rps6ka3P18654 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rps6ka3P18654 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rps6ka3P18654 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rps6ka3P18654 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rps6ka3P18654 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rps6ka3P18654 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rps6ka3P18654 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rps6ka3P18654 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rps6ka3P18654 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rps6ka3P18654 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rps6ka3P18654 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rps6ka3P18654 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rps6ka3P18654 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rps6ka3P18654 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rps6ka3P18654 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rps6ka3P18654 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rps6ka3P18654 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rps6ka3P18654 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps6ka3P18654 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps6ka3P18654 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps6ka3P18654 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps6ka3P18654 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps6ka3P18654 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rps6ka3P18654 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rps6ka3P18654 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rps6ka3P18654 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rps6ka3P18654 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rps6ka3P18654 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rps6ka3P18654 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rps6ka3P18654 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Rps6ka3P18654 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rps6ka3P18654 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rps6ka3P18654 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rps6ka3P18654 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rps6ka3P18654 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rps6ka3P18654 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rps6ka3P18654 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rps6ka3P18654 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rps6ka3P18654 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rps6ka3P18654 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rps6ka3P18654 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps6ka3P18654 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps6ka3P18654 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rps6ka3P18654 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rps6ka3P18654 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rps6ka3P18654 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps6ka3P18654 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps6ka3P18654 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6ka3P18654 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6ka3P18654 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6ka3P18654 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6ka3P18654 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6ka3P18654 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rps6ka3P18654 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rps6ka3P18654 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rps6ka3P18654 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps6ka3P18654 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps6ka3P18654 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps6ka3P18654 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rps6ka3P18654 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps6ka3P18654 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps6ka3P18654 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps6ka3P18654 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rps6ka3P18654 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rps6ka3P18654 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rps6ka3P18654 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rps6ka3P18654 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rps6ka3P18654 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rps6ka3P18654 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rps6ka3P18654 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps6ka3P18654 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms