Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rag1P15919 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rag1P15919 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rag1P15919 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rag1P15919 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Rag1P15919 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rag1P15919 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rag1P15919 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rag1P15919 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rag1P15919 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rag1P15919 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Rag1P15919 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rag1P15919 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rag1P15919 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rag1P15919 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rag1P15919 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rag1P15919 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rag1P15919 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rag1P15919 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rag1P15919 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rag1P15919 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rag1P15919 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rag1P15919 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rag1P15919 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rag1P15919 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rag1P15919 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rag1P15919 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rag1P15919 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rag1P15919 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rag1P15919 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rag1P15919 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rag1P15919 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rag1P15919 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rag1P15919 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rag1P15919 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rag1P15919 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rag1P15919 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rag1P15919 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rag1P15919 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rag1P15919 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rag1P15919 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rag1P15919 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rag1P15919 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rag1P15919 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rag1P15919 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rag1P15919 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rag1P15919 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rag1P15919 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rag1P15919 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rag1P15919 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rag1P15919 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rag1P15919 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rag1P15919 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rag1P15919 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rag1P15919 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rag1P15919 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rag1P15919 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rag1P15919 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rag1P15919 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rag1P15919 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rag1P15919 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rag1P15919 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rag1P15919 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rag1P15919 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rag1P15919 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rag1P15919 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rag1P15919 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rag1P15919 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rag1P15919 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rag1P15919 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rag1P15919 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rag1P15919 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rag1P15919 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rag1P15919 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rag1P15919 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rag1P15919 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rag1P15919 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rag1P15919 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rag1P15919 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rag1P15919 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rag1P15919 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rag1P15919 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rag1P15919 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rag1P15919 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rag1P15919 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rag1P15919 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rag1P15919 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rag1P15919 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rag1P15919 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rag1P15919 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rag1P15919 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rag1P15919 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rag1P15919 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rag1P15919 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rag1P15919 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rag1P15919 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rag1P15919 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rag1P15919 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rag1P15919 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rag1P15919 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms