Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prph2P15499 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prph2P15499 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prph2P15499 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prph2P15499 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prph2P15499 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prph2P15499 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prph2P15499 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prph2P15499 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prph2P15499 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prph2P15499 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prph2P15499 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prph2P15499 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prph2P15499 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prph2P15499 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prph2P15499 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prph2P15499 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Prph2P15499 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prph2P15499 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prph2P15499 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prph2P15499 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prph2P15499 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prph2P15499 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prph2P15499 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prph2P15499 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prph2P15499 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prph2P15499 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prph2P15499 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prph2P15499 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prph2P15499 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prph2P15499 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prph2P15499 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prph2P15499 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prph2P15499 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prph2P15499 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Prph2P15499 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Prph2P15499 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prph2P15499 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prph2P15499 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prph2P15499 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prph2P15499 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prph2P15499 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prph2P15499 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Prph2P15499 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prph2P15499 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prph2P15499 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prph2P15499 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prph2P15499 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prph2P15499 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prph2P15499 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prph2P15499 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prph2P15499 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prph2P15499 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prph2P15499 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prph2P15499 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prph2P15499 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prph2P15499 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prph2P15499 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prph2P15499 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prph2P15499 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prph2P15499 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Prph2P15499 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prph2P15499 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prph2P15499 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prph2P15499 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prph2P15499 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prph2P15499 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prph2P15499 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prph2P15499 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Prph2P15499 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prph2P15499 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prph2P15499 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prph2P15499 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prph2P15499 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prph2P15499 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prph2P15499 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prph2P15499 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prph2P15499 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prph2P15499 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prph2P15499 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prph2P15499 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prph2P15499 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prph2P15499 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prph2P15499 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prph2P15499 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prph2P15499 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prph2P15499 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prph2P15499 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Prph2P15499 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prph2P15499 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prph2P15499 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prph2P15499 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prph2P15499 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prph2P15499 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prph2P15499 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prph2P15499 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prph2P15499 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prph2P15499 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prph2P15499 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prph2P15499 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms