Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cd44P15379 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cd44P15379 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cd44P15379 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cd44P15379 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cd44P15379 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cd44P15379 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cd44P15379 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cd44P15379 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cd44P15379 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Cd44P15379 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cd44P15379 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cd44P15379 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cd44P15379 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cd44P15379 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cd44P15379 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cd44P15379 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cd44P15379 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cd44P15379 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cd44P15379 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cd44P15379 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cd44P15379 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cd44P15379 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cd44P15379 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cd44P15379 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cd44P15379 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cd44P15379 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cd44P15379 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cd44P15379 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cd44P15379 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cd44P15379 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cd44P15379 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cd44P15379 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cd44P15379 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cd44P15379 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cd44P15379 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cd44P15379 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cd44P15379 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cd44P15379 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cd44P15379 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cd44P15379 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Cd44P15379 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cd44P15379 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cd44P15379 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cd44P15379 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cd44P15379 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cd44P15379 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cd44P15379 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cd44P15379 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cd44P15379 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cd44P15379 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cd44P15379 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cd44P15379 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cd44P15379 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cd44P15379 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cd44P15379 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cd44P15379 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cd44P15379 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cd44P15379 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cd44P15379 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cd44P15379 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cd44P15379 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cd44P15379 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cd44P15379 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cd44P15379 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cd44P15379 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cd44P15379 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cd44P15379 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cd44P15379 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cd44P15379 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cd44P15379 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cd44P15379 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cd44P15379 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cd44P15379 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cd44P15379 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cd44P15379 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cd44P15379 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Cd44P15379 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cd44P15379 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cd44P15379 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cd44P15379 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cd44P15379 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Cd44P15379 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cd44P15379 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cd44P15379 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cd44P15379 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cd44P15379 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cd44P15379 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cd44P15379 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cd44P15379 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cd44P15379 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cd44P15379 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cd44P15379 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cd44P15379 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cd44P15379 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Cd44P15379 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cd44P15379 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cd44P15379 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cd44P15379 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cd44P15379 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms