Protein–RNA interactions for Protein: P15116

Cdh2, Cadherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh2P15116 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdh2P15116 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh2P15116 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdh2P15116 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdh2P15116 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdh2P15116 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdh2P15116 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh2P15116 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh2P15116 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh2P15116 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdh2P15116 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cdh2P15116 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh2P15116 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh2P15116 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdh2P15116 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh2P15116 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh2P15116 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh2P15116 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh2P15116 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh2P15116 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh2P15116 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh2P15116 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdh2P15116 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdh2P15116 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh2P15116 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh2P15116 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh2P15116 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh2P15116 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh2P15116 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh2P15116 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh2P15116 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh2P15116 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdh2P15116 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh2P15116 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh2P15116 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh2P15116 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh2P15116 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh2P15116 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh2P15116 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh2P15116 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh2P15116 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh2P15116 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh2P15116 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh2P15116 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh2P15116 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh2P15116 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh2P15116 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh2P15116 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh2P15116 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh2P15116 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh2P15116 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh2P15116 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh2P15116 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh2P15116 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh2P15116 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh2P15116 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh2P15116 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh2P15116 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh2P15116 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh2P15116 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh2P15116 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh2P15116 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh2P15116 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh2P15116 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh2P15116 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh2P15116 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh2P15116 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh2P15116 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh2P15116 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh2P15116 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh2P15116 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh2P15116 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdh2P15116 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdh2P15116 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdh2P15116 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh2P15116 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh2P15116 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh2P15116 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh2P15116 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh2P15116 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh2P15116 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh2P15116 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh2P15116 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh2P15116 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdh2P15116 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdh2P15116 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdh2P15116 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdh2P15116 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh2P15116 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh2P15116 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh2P15116 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh2P15116 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh2P15116 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh2P15116 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh2P15116 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh2P15116 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh2P15116 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh2P15116 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh2P15116 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh2P15116 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.7 ms