Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd1d1P11609 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd1d1P11609 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd1d1P11609 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd1d1P11609 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd1d1P11609 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd1d1P11609 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd1d1P11609 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd1d1P11609 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd1d1P11609 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd1d1P11609 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd1d1P11609 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cd1d1P11609 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd1d1P11609 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd1d1P11609 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd1d1P11609 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd1d1P11609 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd1d1P11609 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd1d1P11609 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd1d1P11609 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd1d1P11609 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd1d1P11609 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd1d1P11609 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd1d1P11609 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd1d1P11609 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd1d1P11609 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd1d1P11609 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd1d1P11609 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd1d1P11609 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd1d1P11609 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd1d1P11609 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd1d1P11609 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd1d1P11609 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd1d1P11609 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd1d1P11609 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd1d1P11609 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd1d1P11609 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cd1d1P11609 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cd1d1P11609 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd1d1P11609 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd1d1P11609 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd1d1P11609 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd1d1P11609 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd1d1P11609 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd1d1P11609 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd1d1P11609 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd1d1P11609 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd1d1P11609 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd1d1P11609 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd1d1P11609 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd1d1P11609 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd1d1P11609 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd1d1P11609 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd1d1P11609 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd1d1P11609 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd1d1P11609 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd1d1P11609 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd1d1P11609 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd1d1P11609 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd1d1P11609 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd1d1P11609 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd1d1P11609 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd1d1P11609 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd1d1P11609 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd1d1P11609 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd1d1P11609 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd1d1P11609 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd1d1P11609 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd1d1P11609 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd1d1P11609 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd1d1P11609 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd1d1P11609 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd1d1P11609 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd1d1P11609 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd1d1P11609 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd1d1P11609 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd1d1P11609 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd1d1P11609 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd1d1P11609 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd1d1P11609 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd1d1P11609 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd1d1P11609 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd1d1P11609 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd1d1P11609 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd1d1P11609 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd1d1P11609 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd1d1P11609 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd1d1P11609 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd1d1P11609 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd1d1P11609 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd1d1P11609 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd1d1P11609 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd1d1P11609 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd1d1P11609 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd1d1P11609 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd1d1P11609 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd1d1P11609 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd1d1P11609 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd1d1P11609 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd1d1P11609 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms