Protein–RNA interactions for Protein: P11033

Gzmd, Granzyme D, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmdP11033 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GzmdP11033 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GzmdP11033 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GzmdP11033 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GzmdP11033 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GzmdP11033 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GzmdP11033 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GzmdP11033 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GzmdP11033 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GzmdP11033 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GzmdP11033 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GzmdP11033 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GzmdP11033 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GzmdP11033 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GzmdP11033 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GzmdP11033 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GzmdP11033 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GzmdP11033 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GzmdP11033 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GzmdP11033 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GzmdP11033 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GzmdP11033 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GzmdP11033 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GzmdP11033 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GzmdP11033 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GzmdP11033 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GzmdP11033 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GzmdP11033 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GzmdP11033 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GzmdP11033 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GzmdP11033 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GzmdP11033 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GzmdP11033 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GzmdP11033 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GzmdP11033 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GzmdP11033 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GzmdP11033 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GzmdP11033 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GzmdP11033 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GzmdP11033 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GzmdP11033 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GzmdP11033 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GzmdP11033 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GzmdP11033 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GzmdP11033 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GzmdP11033 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GzmdP11033 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GzmdP11033 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GzmdP11033 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GzmdP11033 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GzmdP11033 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GzmdP11033 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GzmdP11033 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GzmdP11033 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GzmdP11033 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GzmdP11033 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GzmdP11033 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GzmdP11033 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GzmdP11033 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GzmdP11033 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GzmdP11033 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GzmdP11033 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GzmdP11033 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GzmdP11033 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GzmdP11033 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GzmdP11033 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GzmdP11033 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GzmdP11033 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GzmdP11033 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GzmdP11033 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GzmdP11033 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GzmdP11033 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GzmdP11033 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GzmdP11033 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GzmdP11033 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GzmdP11033 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GzmdP11033 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GzmdP11033 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GzmdP11033 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GzmdP11033 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GzmdP11033 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GzmdP11033 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GzmdP11033 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GzmdP11033 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GzmdP11033 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GzmdP11033 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GzmdP11033 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GzmdP11033 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GzmdP11033 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GzmdP11033 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GzmdP11033 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GzmdP11033 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GzmdP11033 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GzmdP11033 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GzmdP11033 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GzmdP11033 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GzmdP11033 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GzmdP11033 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GzmdP11033 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GzmdP11033 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms