Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Surf1P09925 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Surf1P09925 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Surf1P09925 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Surf1P09925 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Surf1P09925 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Surf1P09925 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Surf1P09925 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Surf1P09925 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Surf1P09925 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Surf1P09925 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Surf1P09925 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Surf1P09925 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Surf1P09925 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Surf1P09925 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Surf1P09925 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Surf1P09925 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Surf1P09925 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Surf1P09925 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Surf1P09925 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Surf1P09925 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Surf1P09925 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Surf1P09925 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Surf1P09925 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Surf1P09925 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Surf1P09925 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Surf1P09925 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Surf1P09925 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Surf1P09925 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Surf1P09925 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Surf1P09925 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Surf1P09925 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Surf1P09925 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Surf1P09925 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Surf1P09925 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Surf1P09925 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Surf1P09925 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Surf1P09925 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Surf1P09925 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Surf1P09925 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Surf1P09925 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Surf1P09925 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Surf1P09925 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Surf1P09925 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Surf1P09925 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Surf1P09925 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Surf1P09925 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Surf1P09925 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Surf1P09925 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Surf1P09925 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Surf1P09925 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Surf1P09925 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Surf1P09925 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Surf1P09925 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Surf1P09925 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Surf1P09925 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Surf1P09925 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Surf1P09925 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Surf1P09925 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Surf1P09925 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Surf1P09925 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Surf1P09925 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Surf1P09925 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Surf1P09925 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Surf1P09925 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Surf1P09925 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Surf1P09925 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Surf1P09925 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Surf1P09925 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Surf1P09925 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Surf1P09925 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Surf1P09925 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Surf1P09925 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Surf1P09925 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Surf1P09925 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Surf1P09925 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Surf1P09925 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Surf1P09925 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Surf1P09925 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Surf1P09925 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Surf1P09925 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Surf1P09925 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Surf1P09925 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Surf1P09925 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Surf1P09925 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Surf1P09925 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Surf1P09925 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Surf1P09925 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Surf1P09925 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Surf1P09925 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Surf1P09925 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Surf1P09925 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Surf1P09925 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Surf1P09925 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Surf1P09925 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Surf1P09925 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Surf1P09925 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Surf1P09925 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Surf1P09925 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Surf1P09925 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms