Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifna9P09235 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifna9P09235 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifna9P09235 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifna9P09235 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifna9P09235 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifna9P09235 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifna9P09235 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ifna9P09235 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ifna9P09235 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifna9P09235 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ifna9P09235 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifna9P09235 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ifna9P09235 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifna9P09235 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifna9P09235 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifna9P09235 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifna9P09235 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ifna9P09235 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifna9P09235 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifna9P09235 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifna9P09235 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifna9P09235 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifna9P09235 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifna9P09235 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifna9P09235 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifna9P09235 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifna9P09235 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifna9P09235 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifna9P09235 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifna9P09235 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifna9P09235 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifna9P09235 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifna9P09235 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifna9P09235 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifna9P09235 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifna9P09235 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifna9P09235 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifna9P09235 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifna9P09235 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifna9P09235 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifna9P09235 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifna9P09235 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifna9P09235 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifna9P09235 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifna9P09235 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifna9P09235 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifna9P09235 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifna9P09235 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifna9P09235 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ifna9P09235 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifna9P09235 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifna9P09235 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifna9P09235 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifna9P09235 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifna9P09235 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifna9P09235 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifna9P09235 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifna9P09235 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifna9P09235 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifna9P09235 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifna9P09235 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifna9P09235 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifna9P09235 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifna9P09235 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifna9P09235 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifna9P09235 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ifna9P09235 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ifna9P09235 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ifna9P09235 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ifna9P09235 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ifna9P09235 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ifna9P09235 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ifna9P09235 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ifna9P09235 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ifna9P09235 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ifna9P09235 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ifna9P09235 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ifna9P09235 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ifna9P09235 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ifna9P09235 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ifna9P09235 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ifna9P09235 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ifna9P09235 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ifna9P09235 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ifna9P09235 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ifna9P09235 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ifna9P09235 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ifna9P09235 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ifna9P09235 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ifna9P09235 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ifna9P09235 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ifna9P09235 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ifna9P09235 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ifna9P09235 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ifna9P09235 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ifna9P09235 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ifna9P09235 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ifna9P09235 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ifna9P09235 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms