Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxa5P09021 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxa5P09021 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxa5P09021 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxa5P09021 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxa5P09021 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxa5P09021 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxa5P09021 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxa5P09021 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxa5P09021 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxa5P09021 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxa5P09021 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxa5P09021 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxa5P09021 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxa5P09021 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxa5P09021 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxa5P09021 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxa5P09021 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxa5P09021 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxa5P09021 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxa5P09021 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxa5P09021 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxa5P09021 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxa5P09021 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa5P09021 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa5P09021 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa5P09021 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxa5P09021 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxa5P09021 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxa5P09021 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxa5P09021 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxa5P09021 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxa5P09021 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxa5P09021 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxa5P09021 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxa5P09021 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxa5P09021 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxa5P09021 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxa5P09021 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxa5P09021 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxa5P09021 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxa5P09021 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxa5P09021 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxa5P09021 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxa5P09021 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxa5P09021 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxa5P09021 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxa5P09021 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxa5P09021 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxa5P09021 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxa5P09021 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxa5P09021 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxa5P09021 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxa5P09021 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxa5P09021 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxa5P09021 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxa5P09021 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxa5P09021 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxa5P09021 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxa5P09021 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxa5P09021 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxa5P09021 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxa5P09021 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxa5P09021 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxa5P09021 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxa5P09021 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxa5P09021 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxa5P09021 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxa5P09021 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxa5P09021 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxa5P09021 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxa5P09021 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxa5P09021 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxa5P09021 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxa5P09021 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxa5P09021 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxa5P09021 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxa5P09021 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxa5P09021 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxa5P09021 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxa5P09021 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxa5P09021 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxa5P09021 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hoxa5P09021 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hoxa5P09021 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxa5P09021 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxa5P09021 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxa5P09021 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxa5P09021 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxa5P09021 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxa5P09021 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxa5P09021 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxa5P09021 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxa5P09021 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxa5P09021 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxa5P09021 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxa5P09021 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa5P09021 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa5P09021 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa5P09021 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms