Protein–RNA interactions for Protein: P08923

Ltk, Leukocyte tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtkP08923 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LtkP08923 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LtkP08923 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LtkP08923 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LtkP08923 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LtkP08923 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LtkP08923 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LtkP08923 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LtkP08923 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LtkP08923 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LtkP08923 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LtkP08923 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LtkP08923 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LtkP08923 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LtkP08923 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LtkP08923 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LtkP08923 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LtkP08923 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LtkP08923 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LtkP08923 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LtkP08923 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LtkP08923 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LtkP08923 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LtkP08923 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
LtkP08923 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LtkP08923 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
LtkP08923 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LtkP08923 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LtkP08923 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LtkP08923 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LtkP08923 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LtkP08923 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LtkP08923 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LtkP08923 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LtkP08923 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LtkP08923 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
LtkP08923 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LtkP08923 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LtkP08923 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
LtkP08923 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LtkP08923 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LtkP08923 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LtkP08923 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LtkP08923 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LtkP08923 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LtkP08923 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LtkP08923 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LtkP08923 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LtkP08923 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LtkP08923 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LtkP08923 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LtkP08923 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LtkP08923 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LtkP08923 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LtkP08923 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LtkP08923 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LtkP08923 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LtkP08923 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
LtkP08923 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LtkP08923 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LtkP08923 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LtkP08923 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LtkP08923 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LtkP08923 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LtkP08923 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LtkP08923 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LtkP08923 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LtkP08923 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LtkP08923 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LtkP08923 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LtkP08923 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LtkP08923 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LtkP08923 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LtkP08923 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LtkP08923 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LtkP08923 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LtkP08923 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LtkP08923 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LtkP08923 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LtkP08923 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LtkP08923 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LtkP08923 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LtkP08923 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LtkP08923 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LtkP08923 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LtkP08923 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
LtkP08923 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LtkP08923 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LtkP08923 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LtkP08923 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
LtkP08923 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LtkP08923 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LtkP08923 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LtkP08923 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LtkP08923 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LtkP08923 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LtkP08923 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LtkP08923 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LtkP08923 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LtkP08923 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms