Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col4a2P08122 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col4a2P08122 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col4a2P08122 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col4a2P08122 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col4a2P08122 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a2P08122 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a2P08122 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a2P08122 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a2P08122 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a2P08122 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a2P08122 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col4a2P08122 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col4a2P08122 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Col4a2P08122 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col4a2P08122 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col4a2P08122 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Col4a2P08122 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col4a2P08122 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col4a2P08122 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col4a2P08122 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col4a2P08122 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a2P08122 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col4a2P08122 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col4a2P08122 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col4a2P08122 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col4a2P08122 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col4a2P08122 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a2P08122 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a2P08122 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a2P08122 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col4a2P08122 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col4a2P08122 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col4a2P08122 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a2P08122 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a2P08122 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a2P08122 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col4a2P08122 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col4a2P08122 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col4a2P08122 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Col4a2P08122 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col4a2P08122 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Col4a2P08122 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col4a2P08122 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col4a2P08122 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col4a2P08122 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col4a2P08122 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a2P08122 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Col4a2P08122 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a2P08122 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Col4a2P08122 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col4a2P08122 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col4a2P08122 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col4a2P08122 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Col4a2P08122 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col4a2P08122 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col4a2P08122 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col4a2P08122 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col4a2P08122 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col4a2P08122 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a2P08122 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a2P08122 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a2P08122 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a2P08122 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Col4a2P08122 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col4a2P08122 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col4a2P08122 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col4a2P08122 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col4a2P08122 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col4a2P08122 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col4a2P08122 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col4a2P08122 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col4a2P08122 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col4a2P08122 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col4a2P08122 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a2P08122 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a2P08122 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col4a2P08122 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col4a2P08122 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col4a2P08122 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col4a2P08122 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col4a2P08122 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Col4a2P08122 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col4a2P08122 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a2P08122 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a2P08122 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col4a2P08122 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a2P08122 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a2P08122 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a2P08122 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a2P08122 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col4a2P08122 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col4a2P08122 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col4a2P08122 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col4a2P08122 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col4a2P08122 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a2P08122 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a2P08122 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col4a2P08122 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col4a2P08122 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms