Protein–RNA interactions for Protein: P06320

T-cell receptor beta chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06320 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06320 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06320 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06320 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06320 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06320 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06320 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06320 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06320 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06320 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06320 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06320 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06320 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06320 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06320 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06320 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06320 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06320 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06320 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06320 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06320 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06320 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06320 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06320 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06320 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P06320 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P06320 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P06320 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P06320 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06320 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P06320 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06320 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P06320 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06320 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06320 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06320 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06320 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06320 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P06320 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06320 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P06320 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P06320 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06320 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06320 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06320 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06320 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P06320 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P06320 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P06320 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P06320 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P06320 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P06320 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P06320 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P06320 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P06320 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P06320 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P06320 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P06320 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P06320 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P06320 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P06320 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06320 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06320 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06320 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P06320 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06320 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06320 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06320 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06320 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06320 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06320 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P06320 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06320 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06320 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06320 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06320 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06320 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06320 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06320 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06320 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P06320 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P06320 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P06320 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P06320 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P06320 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06320 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06320 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06320 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06320 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06320 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06320 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P06320 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06320 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06320 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06320 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P06320 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06320 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
P06320 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06320 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06320 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms